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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_026027
当前版本: OH-1004 染色体: Chr05 坐标: 119907953-119912325 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3165 bp · LXL04_026027|LXL04_026027|OH1004|cDNA

ATGTCAGCTGCTATGGGCGATGGCAACGAATCTCGACCCTTCACCTCCTCCTCCATAGAATGCCATGCCTATGAATATCCTGAGATTCTCATAGCAACCAATAACTTTGACCAATCATTAGTAATTGGGGAAGGAGGGTTTGGAATAGTTTACAAAGGTGAGTTTGTCAACGAATCAGGTGTTTTGGTTGCTGCCATTAAACGGTTGATCAATTCTGAGGTCACGCAAGCAGATTCTCAGTTCTGGGCGGAAGTTGAGAC...

CDS

下载 CDS FASTA

3165 bp · LXL04_026027|LXL04_026027|OH1004|CDS

ATGTCAGCTGCTATGGGCGATGGCAACGAATCTCGACCCTTCACCTCCTCCTCCATAGAATGCCATGCCTATGAATATCCTGAGATTCTCATAGCAACCAATAACTTTGACCAATCATTAGTAATTGGGGAAGGAGGGTTTGGAATAGTTTACAAAGGTGAGTTTGTCAACGAATCAGGTGTTTTGGTTGCTGCCATTAAACGGTTGATCAATTCTGAGGTCACGCAAGCAGATTCTCAGTTCTGGGCGGAAGTTGAGAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1054 aa · LXL04_026027|LXL04_026027|OH1004|PROTEIN

MSAAMGDGNESRPFTSSSIECHAYEYPEILIATNNFDQSLVIGEGGFGIVYKGEFVNESGVLVAAIKRLINSEVTQADSQFWAEVETLSKLRHCNLVPLIGYCSYGREMILVYQYMPNGTLEDNLHKLGTYISWRDRLQICLDAARGLDYLHTGTGIDVGIMHRDVKSSNILLDESWGAKISDFGLSILGPTDQPLNFVNAPVPITRGYVDLDYYYSGMLTSKCDVYNFGVVLLEVVCRKRALDSSLGEEQCVLVTWAQD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_026027
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_026027
位置Chr05:119907953-119912325 (+)
描述Similar to At5g61350: Probable receptor-like protein kinase At5g61350
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g61350 可能的受体样蛋白激酶 At5g61350。 暂无已核实直接文献
At5g39000 推测的受体样蛋白激酶At5g39000。 暂无已核实直接文献
At5g38990 可能的受体样蛋白激酶At5g38990。 暂无已核实直接文献
At3g51550 可能通过调节雌配子体助细胞中 MLO7 的极性定位，参与受精时对花粉管生长及雄配子递送的调控。
FERONIA receptor-like kinase regulates RHO GTPase signaling of root hair development.2010 · DOI: 10.1073/pnas.1005366107
At5g02290 可能在植物生长和发育的调节中发挥作用（可能）。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026027 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0051924 regulation of calcium ion transport 生物过程
GO:0080147 root hair cell development 生物过程
GO:0097275 intracellular ammonium homeostasis 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009705 plant-type vacuole membrane 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0004714 transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G02290
ath:AT5G61350
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.525
排名 1 · LXL04_026027 · OH-1004
细胞质0.381
排名 2 · LXL04_026027 · OH-1004
细胞核0.222
排名 3 · LXL04_026027 · OH-1004
内质网0.045
排名 4 · LXL04_026027 · OH-1004
高尔基体0.043
排名 5 · LXL04_026027 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069.32Pkinase40-310 aa
PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr41-311 aa
PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr369-518 aa
PF00069.32Pkinase369-529 aa
PF00069.32Pkinase529-670 aa
PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr531-672 aa
PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr780-1047 aa
PF00069.32Pkinase803-1045 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_026027PF00069.32Pkinase403101.4e-119399.1
LXL04_026027PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr413117.5e-127422.7
LXL04_026027PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr3695187.5e-127422.7
LXL04_026027PF00069.32Pkinase3695291.4e-119399.1
LXL04_026027PF00069.32Pkinase5296701.4e-119399.1
LXL04_026027PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr5316727.5e-127422.7
LXL04_026027PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr78010477.5e-127422.7
LXL04_026027PF00069.32Pkinase80310451.4e-119399.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FLJ8拟南芥Probable receptor-like protein kinase At5g6135043.697%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9FID8拟南芥Putative receptor-like protein kinase At5g3900042.857%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9FID9拟南芥Probable receptor-like protein kinase At5g3899042.857%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9SCZ4拟南芥Receptor-like protein kinase FERONIA42.493%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
P43293拟南芥Probable serine/threonine-protein kinase PBL1142.810%Swiss-Prot低置信数据库同源证据

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