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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_025784
当前版本: OH-1004 染色体: Chr05 坐标: 116870602-116876225 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1890 bp · LXL04_025784|LXL04_025784|OH1004|cDNA

ATGCCGTCTGTATCTGTAAAGCTCTACAGTGTTCTTCATAAATTCATTTTGAAACGCCAATTGCAAACCCTCAGTGAAACCCACACCAAAATCTTCAATCAATTCGGTGTCGTATCACGCCCCGATGAATCCGTCGCTCCGGCCAACCCTAGCTTCTCTGAAGACGGCGTCGCTACCAAAGATATCCATATTGATCCTTTGACATCTCTCACCCTCCGGATCTTTCTCCCCGATTCAGTACTTGCGAAATCAAGAGGGTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1890 bp · LXL04_025784|LXL04_025784|OH1004|CDS

ATGCCGTCTGTATCTGTAAAGCTCTACAGTGTTCTTCATAAATTCATTTTGAAACGCCAATTGCAAACCCTCAGTGAAACCCACACCAAAATCTTCAATCAATTCGGTGTCGTATCACGCCCCGATGAATCCGTCGCTCCGGCCAACCCTAGCTTCTCTGAAGACGGCGTCGCTACCAAAGATATCCATATTGATCCTTTGACATCTCTCACCCTCCGGATCTTTCTCCCCGATTCAGTACTTGCGAAATCAAGAGGGTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

629 aa · LXL04_025784|LXL04_025784|OH1004|PROTEIN

MPSVSVKLYSVLHKFILKRQLQTLSETHTKIFNQFGVVSRPDESVAPANPSFSEDGVATKDIHIDPLTSLTLRIFLPDSVLAKSRGLNQGDGVYGGYSPALGDTLRKLPVVLQFHGGGFATGSNVSVANDLFCRRIAKACDAIVVAVGYRLAPESKYPAAFEDGVEALSWLAKQANLAECRISGRVDLRRRQIVDGFGSSMIEPWIAAHADLSRCVLLGVSSGSNIANYVTQKAVEAGNLLDPVRVVAQVLMYPFVIGNT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_025784
TK1151 IDTkA03G008120
OH-1004 IDLXL04_025784
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)56.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 96.957 / OH-1004 60.095
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_025784
位置Chr05:116870602-116876225 (+)
描述Similar to CXE16: Probable carboxylesterase 16
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g14310 对不同脂肪酸链长度的酯类发挥作用的羧基酯酶。 暂无已核实直接文献
At3g27320 对不同脂肪酸链长度的酯类发挥作用的羧基酯酶。 暂无已核实直接文献
At3g63010 作为可溶性赤霉素 受体发挥作用。
Identification and characterization of Arabidopsis gibberellin receptors.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2006.02748.x
Genetic characterization and functional analysis of the GID1 gibberellin receptors in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1105/tpc.106.047415
Multiple loss-of-function of Arabidopsis gibberellin receptor AtGID1s completely shuts down a gibberellin signal.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03098.x
At3g05120 作为可溶性赤霉素 受体发挥作用。
Identification and characterization of Arabidopsis gibberellin receptors.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2006.02748.x
Genetic characterization and functional analysis of the GID1 gibberellin receptors in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1105/tpc.106.047415
Multiple loss-of-function of Arabidopsis gibberellin receptor AtGID1s completely shuts down a gibberellin signal.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03098.x

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025784 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009739 response to gibberellin 生物过程
GO:0009939 positive regulation of gibberellic acid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0010476 gibberellin mediated signaling pathway 生物过程
GO:0010629 negative regulation of gene expression 生物过程
GO:0048444 floral organ morphogenesis 生物过程
GO:0048530 fruit morphogenesis 生物过程
GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程
GO:1905516 positive regulation of fertilization 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0010331 gibberellin binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G05120
ath:AT3G27320
ath:AT3G63010
ath:AT5G14310
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.426
排名 1 · LXL04_025784 · OH-1004
细胞核0.297
排名 2 · LXL04_025784 · OH-1004
细胞膜0.121
排名 3 · LXL04_025784 · OH-1004
内质网0.101
排名 4 · LXL04_025784 · OH-1004
质体0.100
排名 5 · LXL04_025784 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF20434.6BD-FAE106-176 aa
PF07859.20Abhydrolase_3111-357 aa
PF13966.12zf-RVT419-486 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_025784PF20434.6BD-FAE1061764.6e-0833.5
LXL04_025784PF07859.20Abhydrolase_31113571.1e-55189.4
LXL04_025784PF13966.12zf-RVT4194862.3e-1041.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8LED9拟南芥Probable carboxylesterase 1661.060%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9LK21拟南芥Probable carboxylesterase 1158.259%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9LYC1拟南芥Gibberellin receptor GID1B31.361%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9MAA7拟南芥Gibberellin receptor GID1A30.625%Swiss-Prot低置信数据库同源证据

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