LXL04_025771 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_025771

当前版本: OH-1004 染色体: Chr05 坐标: 116789976-116791611 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

738 bp · LXL04_025771|LXL04_025771|OH1004|cDNA

ATGGCGAGCATCAGCACCTCCTTGGAAGATGTACCTTCTACCGACATCATGACTGAACTCCTCCGCCGACTCAAGTGCTCATCCAAGCCCGATAAGCGCCTCATCCTCATTGGTCCACCCGGATCTGGAAAAGGTACCCAATCGCCCATCATCAAGGACGAATTCTGCCTATGCCACCTGGCAACCGGTGATATGTTGAGAGCAGCCGTCGCTGCTAAAACCCCACTCGGTATCAAAGCCAAAGAAACCATGGAGAAGGG...

CDS

下载 CDS FASTA

738 bp · LXL04_025771|LXL04_025771|OH1004|CDS

ATGGCGAGCATCAGCACCTCCTTGGAAGATGTACCTTCTACCGACATCATGACTGAACTCCTCCGCCGACTCAAGTGCTCATCCAAGCCCGATAAGCGCCTCATCCTCATTGGTCCACCCGGATCTGGAAAAGGTACCCAATCGCCCATCATCAAGGACGAATTCTGCCTATGCCACCTGGCAACCGGTGATATGTTGAGAGCAGCCGTCGCTGCTAAAACCCCACTCGGTATCAAAGCCAAAGAAACCATGGAGAAGGG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

245 aa · LXL04_025771|LXL04_025771|OH1004|PROTEIN

MASISTSLEDVPSTDIMTELLRRLKCSSKPDKRLILIGPPGSGKGTQSPIIKDEFCLCHLATGDMLRAAVAAKTPLGIKAKETMEKGELVSDDLVVGIIDEAMKKPSCQKGFILDGFPRTVAQAEKLDEMLQKQGTKIDKVLDFAINDSILEERITGRWIHASSGRTYHTKFAPPKTPGVDDVTGEPLMQRKDDTAQVLKSRLEAFHRQTEPVIEYYNKKGVVAKLPAEKPPKEVTVEVQKVLST

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_025771`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_025771

位置 Chr05:116789976-116791611 (+)

描述 Similar to ADK-B: Adenylate kinase 4

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g63400`	催化 ATP 和 AMP 之间末端磷酸基团的可逆转移。	暂无已核实直接文献
`At5g50370`	催化 ATP 和 AMP 之间末端磷酸基团的可逆转移。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`UniProt: Q08480`	催化 ATP 和 AMP 之间末端磷酸基团的可逆转移。	暂无已核实直接文献
`Os12g0236400`	催化 ATP 和 AMP 之间末端磷酸基团的可逆转移。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025771 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006163 purine nucleotide metabolic process 生物过程

GO:0006172 ADP biosynthetic process 生物过程

GO:0046033 AMP metabolic process 生物过程

GO:0046034 ATP metabolic process 生物过程

GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005758 mitochondrial intermembrane space 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0009536 plastid 细胞组分

GO:0004017 AMP kinase activity 分子功能

GO:0005507 copper ion binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT5G50370

ath:AT5G63400

dmo:Dmoj_GI20701

dosa:Os11g0312400

dosa:Os12g0236400

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.583

排名 1 · LXL04_025771 · OH-1004

细胞质0.331

排名 2 · LXL04_025771 · OH-1004

细胞核0.125

排名 3 · LXL04_025771 · OH-1004

质体0.088

排名 4 · LXL04_025771 · OH-1004

过氧化物酶体0.068

排名 5 · LXL04_025771 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00406.30ADK36-221 aa

PF13207.13AAA_1737-157 aa

PF05191.21ADK_lid158-193 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_025771	`PF00406.30`	ADK	36	221	7.4e-60	202.2
LXL04_025771	`PF13207.13`	AAA_17	37	157	1.2e-24	87.9
LXL04_025771	`PF05191.21`	ADK_lid	158	193	1.4e-16	60.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`O82514`	拟南芥	Adenylate kinase 4	79.583%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q9FK35`	拟南芥	Adenylate kinase 3	75.820%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q08480`	水稻	Adenylate kinase 4	86.667%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q08479`	水稻	Adenylate kinase 3	85.892%	Swiss-Prot	强数据库同源证据

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