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基因概览

LXL04_025745

当前版本: OH-1004 染色体: Chr05 坐标: 116359355-116360734 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1105 bp · LXL04_025745|LXL04_025745|OH1004|cDNA

GCAGTTGCTAGATTGGATGCATCGCAAGTTTAGGAACGGAGAGCCACTAAAAGAATTTCCTACAGGGAACCCTTGTACTTGTCTTATGGGGCAACCATCACTCGACGATTTAGAGTATTATCCTAAATCAAACTATTACGCGAAACCATCGACCAAATCACGTGAAAATCAGCTCCTAAAATCGTTTTCATGCATAAGAGCAGATGACGAACACATGGGAGAAGAAGAATCATCGTCTGCTCTTTCCGAACTCTTTCATG...

CDS

下载 CDS FASTA

1101 bp · LXL04_025745|LXL04_025745|OH1004|CDS

TTGCTAGATTGGATGCATCGCAAGTTTAGGAACGGAGAGCCACTAAAAGAATTTCCTACAGGGAACCCTTGTACTTGTCTTATGGGGCAACCATCACTCGACGATTTAGAGTATTATCCTAAATCAAACTATTACGCGAAACCATCGACCAAATCACGTGAAAATCAGCTCCTAAAATCGTTTTCATGCATAAGAGCAGATGACGAACACATGGGAGAAGAAGAATCATCGTCTGCTCTTTCCGAACTCTTTCATGGATT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

366 aa · LXL04_025745|LXL04_025745|OH1004|PROTEIN

MLDWMHRKFRNGEPLKEFPTGNPCTCLMGQPSLDDLEYYPKSNYYAKPSTKSRENQLLKSFSCIRADDEHMGEEESSSALSELFHGFLAIGTLGTDPVTSDPATPTFSTSVQYIMEKETEATENELQFFNDELEKVLGADGKEDDSSRRDSYVSVGRSSHGSTITLGGKPLEAAENEIGGVACPLQGYLFGSTVGLPETTPGKKEHRTSLGELFQKTKIAEESNGVKCNHTRVEKQKEKDADKSAVHLVKKILKGIKASH...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_025745`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_025745

位置 Chr05:116359355-116360734 (+)

描述 Similar to LA1: Protein LAZY 1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g14090`	参与芽向地性的调节。	AtLAZY1 is a signaling component required for gravitropism of the Arabidopsis thaliana inflorescence.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12118 Strigolactones regulate rice tiller angle by attenuating shoot gravitropism through inhibiting auxin biosynthesis.2014 · DOI: 10.1073/pnas.1411859111 The Arabidopsis LAZY1 Family Plays a Key Role in Gravity Signaling within Statocytes and in Branch Angle Control of Roots and Shoots.2017 · DOI: 10.1105/tpc.16.00575 LAZY Genes Mediate the Effects of Gravity on Auxin Gradients and Plant Architecture.2017 · DOI: 10.1104/pp.17.00942

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os11g0490600`	通过负调控向下极性生长素运输（PAT）参与茎重力性和分蘖角度的调控。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025745 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009630 gravitropism 生物过程

GO:0009958 positive gravitropism 生物过程

GO:0009959 negative gravitropism 生物过程

GO:2000012 regulation of auxin polar transport 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT5G14090

dosa:Os11g0490600

zma:100193776

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.464

排名 1 · LXL04_025745 · OH-1004

细胞核0.358

排名 2 · LXL04_025745 · OH-1004

细胞质0.354

排名 3 · LXL04_025745 · OH-1004

内质网0.055

排名 4 · LXL04_025745 · OH-1004

线粒体0.033

排名 5 · LXL04_025745 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF28425.1LAZY_C59-145 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_025745	`PF28425.1`	LAZY_C	59	145	2.6e-09	37.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q5XV40`	拟南芥	Protein LAZY 1	35.676%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q2R435`	水稻	Protein LAZY 1	25.523%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据

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