LXL04_025675 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_025675

当前版本: OH-1004 染色体: Chr05 坐标: 115083477-115085192 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1485 bp · LXL04_025675|LXL04_025675|OH1004|cDNA

ATGGAGCTTCTGCATCTAATCCTCTCCTCCCTCATTTTATTTTTCACTTTCTTACATGGCCTCGACCTTTACCGGAAAAGAAGACTCCCGCCTGGTCCCGTCGGCCTCCCCATCATCGGAAACATCCTTGACCTCGGACCAAAACCCCACGAATCCCTAGCCAAGCTCGCACAAAAACATGGCCCACTAATGACCATCCGATTAGGCAACGTCACCAGCGTGGTGGCATCAACACCCGATGCCGCCAGACAAGTCCTCCA...

CDS

下载 CDS FASTA

1485 bp · LXL04_025675|LXL04_025675|OH1004|CDS

ATGGAGCTTCTGCATCTAATCCTCTCCTCCCTCATTTTATTTTTCACTTTCTTACATGGCCTCGACCTTTACCGGAAAAGAAGACTCCCGCCTGGTCCCGTCGGCCTCCCCATCATCGGAAACATCCTTGACCTCGGACCAAAACCCCACGAATCCCTAGCCAAGCTCGCACAAAAACATGGCCCACTAATGACCATCCGATTAGGCAACGTCACCAGCGTGGTGGCATCAACACCCGATGCCGCCAGACAAGTCCTCCA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

494 aa · LXL04_025675|LXL04_025675|OH1004|PROTEIN

MELLHLILSSLILFFTFLHGLDLYRKRRLPPGPVGLPIIGNILDLGPKPHESLAKLAQKHGPLMTIRLGNVTSVVASTPDAARQVLQLHDDACSGRRVPDVIAAAKHPDAAILWMPPNDTWRAMRKAMNMYLTNQKTLDSLSGLRENVAAGMLEFLQESCRKNMPVDIGKLAFAAALNQMSNTIFSQNVTNYDSESLGGFVTAVETVMQVLGEFNIADFFPVLKPLDPQNVRRRAREAFRWLEVVIEDLVSERVKNRELN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_025675`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID	`LXL04_025675`
位置	Chr05:115083477-115085192 (+)
描述	Similar to CYP76T24: Cytochrome P450 76T24
拟南芥 / 水稻参考基因与文献	下载当前基因文献拟南芥当前来源表未检出该物种的同源命中。水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。
功能注释来源	查看注释来源功能注释来源：OH1004 · `LXL04_025675` · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
GO 注释（OH1004 来源）	GO:0016099 monoterpenoid biosynthetic process 生物过程 GO:0016102 diterpenoid biosynthetic process 生物过程 GO:0016114 terpenoid biosynthetic process 生物过程 GO:1901946 miltiradiene biosynthetic process 生物过程 GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分 GO:0016020 membrane 细胞组分 GO:0031969 chloroplast membrane 细胞组分 GO:0004497 monooxygenase activity 分子功能 GO:0005506 iron ion binding 分子功能 GO:0016705 oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen 分子功能 GO:0016709 oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, NAD(P)H as one donor, and incorporation of one atom of oxygen 分子功能 GO:0016712 oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, reduced flavin or flavoprotein as one donor, and incorporation of one atom of oxygen 分子功能
KEGG 基因交叉引用	ag:AGN04215 ag:CAC80883 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.921

排名 1 · LXL04_025675 · OH-1004

细胞膜0.042

排名 2 · LXL04_025675 · OH-1004

细胞质0.035

排名 3 · LXL04_025675 · OH-1004

质体0.027

排名 4 · LXL04_025675 · OH-1004

线粒体0.024

排名 5 · LXL04_025675 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00067.28p45030-473 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_025675	`PF00067.28`	p450	30	473	2.1e-103	347.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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