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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_025281
当前版本: OH-1004 染色体: Chr05 坐标: 109105528-109107793 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1260 bp · LXL04_025281|LXL04_025281|OH1004|cDNA

ATGGGGATTTGCTGTTCATCGCATAATAAAGTTCCTGGGACCATTCTCGATCCCAGTTCAGGGTTTTCGCAGTCAGTCACCACAAACAATACCACAAGCTCATCATTATCGTCACGCGGTGGCAGCAACATCTCCCGGAGCAGCCAGTTTTGGTCGGCAAACAGCGGCGATGAATTTGGACCAGACGGCCAGATCTTACCTCACCCCAACCTTAAAATATACACCTTCTCTGAACTCAAAACCGCCACAAAAAACTTCAG...

CDS

下载 CDS FASTA

1260 bp · LXL04_025281|LXL04_025281|OH1004|CDS

ATGGGGATTTGCTGTTCATCGCATAATAAAGTTCCTGGGACCATTCTCGATCCCAGTTCAGGGTTTTCGCAGTCAGTCACCACAAACAATACCACAAGCTCATCATTATCGTCACGCGGTGGCAGCAACATCTCCCGGAGCAGCCAGTTTTGGTCGGCAAACAGCGGCGATGAATTTGGACCAGACGGCCAGATCTTACCTCACCCCAACCTTAAAATATACACCTTCTCTGAACTCAAAACCGCCACAAAAAACTTCAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

419 aa · LXL04_025281|LXL04_025281|OH1004|PROTEIN

MGICCSSHNKVPGTILDPSSGFSQSVTTNNTTSSSLSSRGGSNISRSSQFWSANSGDEFGPDGQILPHPNLKIYTFSELKTATKNFRNDTVLGEGGFGKVHKGFIEEKSISKHGTGSVIAVKKLNSESMQGLEEWQAEVNFLGRLSHPNLVKLLGYCYEGKELLLVYEFMQKGSLENHLFGRGSSVQSLPWDLRVKILIGAARGLAFLHSSDIKIIYRDFKASNILLDGSYNGKLSDFGLAKLASSSQSHVTTRVMGTYG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_025281
TK1151 IDTkA06G070150
OH-1004 IDLXL04_025281
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_025281
位置Chr05:109105528-109107793 (+)
描述Similar to PIX13: Probable serine/threonine-protein kinase PIX13
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g17220 可能参与植物防御信号传导。 暂无已核实直接文献
At4g35600 作为信号转导的空间抑制因子，调节离层细胞的黏附和扩张。 暂无已核实直接文献
At1g07570 可能的双功能激酶。
Novel protein kinase of Arabidopsis thaliana (APK1) that phosphorylates tyrosine, serine and threonine.1992 · DOI: 10.1007/bf00046450
At2g28930 可能的双功能激酶。
Light-induced stomatal opening is affected by the guard cell protein kinase APK1b.2014 · DOI: 10.1371/journal.pone.0097161

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os05g0110900 在介导先天免疫的微生物肽聚糖 和真菌几丁质信号通路中的 CERK1 下游发挥作用。
OsCERK1 and OsRLCK176 play important roles in peptidoglycan and chitin signaling in rice innate immunity.2014 · DOI: 10.1111/tpj.12710
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025281 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009838 abscission 生物过程
GO:0045087 innate immune response 生物过程
GO:0060862 negative regulation of floral organ abscission 生物过程
GO:1902458 positive regulation of stomatal opening 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0004713 protein tyrosine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G07570
ath:AT2G17220
ath:AT2G28930
ath:AT4G35600
dosa:Os05g0110900
osa:4337593
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.685
排名 1 · LXL04_025281 · OH-1004
细胞质0.245
排名 2 · LXL04_025281 · OH-1004
细胞核0.241
排名 3 · LXL04_025281 · OH-1004
内质网0.037
排名 4 · LXL04_025281 · OH-1004
高尔基体0.027
排名 5 · LXL04_025281 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069.32Pkinase88-363 aa
PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr89-365 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_025281PF00069.32Pkinase883632.6e-45155.6
LXL04_025281PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr893652.1e-46159.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SII6拟南芥Probable serine/threonine-protein kinase PIX1364.973%Swiss-Prot强数据库同源证据
P27450拟南芥Probable serine/threonine-protein kinase CST53.230%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q06548拟南芥Probable serine/threonine-protein kinase PBL956.150%Swiss-Prot强数据库同源证据
P46573拟南芥Probable serine/threonine-protein kinase PBL1060.635%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q65XV8水稻Receptor-like cytoplasmic kinase 17658.824%Swiss-Prot强数据库同源证据

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