基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_024998
当前版本: OH-1004
染色体: Chr05
坐标: 103775111-103780372
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA3840 bp · LXL04_024998|LXL04_024998|OH1004|cDNA
ATGATTATCGTCTTCTTTTTGGCCTCTGTTCTTCTCTCTTGTCTACCGTTCCTTCATTCTACTACAGACCTCAACACTACTATGTCTACCTGCCCAAACGGTTTTACTTGCCCAAAAATTTCTCCATTCGAGTACCCGTTTTATAATACCAGTGACAGCCGGTGTGGTTTGATCAAGGTCAACTGTAGTTCGAGTAGTAGCAAAATTAAATTTGGAGAAGAGTCATTTGAGATTGTTTCCAAGTTCATGCCTGGTCCTTC...
CDS
下载 CDS FASTA3840 bp · LXL04_024998|LXL04_024998|OH1004|CDS
ATGATTATCGTCTTCTTTTTGGCCTCTGTTCTTCTCTCTTGTCTACCGTTCCTTCATTCTACTACAGACCTCAACACTACTATGTCTACCTGCCCAAACGGTTTTACTTGCCCAAAAATTTCTCCATTCGAGTACCCGTTTTATAATACCAGTGACAGCCGGTGTGGTTTGATCAAGGTCAACTGTAGTTCGAGTAGTAGCAAAATTAAATTTGGAGAAGAGTCATTTGAGATTGTTTCCAAGTTCATGCCTGGTCCTTC...
1279 aa · LXL04_024998|LXL04_024998|OH1004|PROTEIN
MIIVFFLASVLLSCLPFLHSTTDLNTTMSTCPNGFTCPKISPFEYPFYNTSDSRCGLIKVNCSSSSSKIKFGEESFEIVSKFMPGPSVLIRNRTFETQVNDQSCDALMDNFTSPIPLLYSITIVPFITLYKCKTNGNDDAKMEAYFKQSDYNRYTRCRDHNFYYQYIVGESTIPSDLPSTCEVIRLPVIAQWSNGATQRLDETNIFSLLNSNFSVTFHVSSSCKDCRKREGECHAQDGSFQCLNARKYEKQKHGKTLLLT...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_024998 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_024998 |
|---|---|
| 位置 | Chr05:103775111-103780372 (+) |
| 描述 | Similar to LRK10L-1.1: LEAF RUST 10 DISEASE-RESISTANCE LOCUS RECEPTOR-LIKE PROTEIN KINASE-like 1.1 |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0042631 cellular response to water deprivation 生物过程 GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程 GO:0048573 photoperiodism, flowering 生物过程 GO:0071215 cellular response to abscisic acid stimulus 生物过程 GO:0005576 extracellular region 细胞组分 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 GO:0009507 chloroplast 细胞组分 GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能 GO:0005524 ATP binding 分子功能 GO:0030247 polysaccharide binding 分子功能 GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G18390 ath:AT1G25390 ath:AT5G38210 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞膜0.710
细胞质0.124
内质网0.093
溶酶体／液泡0.077
细胞外0.060
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF14380.12WAK_assoc168-244 aaPF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr327-595 aaPF00069.32Pkinase327-594 aaPF00069.32Pkinase953-1221 aaPF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr954-1222 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_024998 | PF14380.12 | WAK_assoc | 168 | 244 | 7.9e-11 | 43.2 |
| LXL04_024998 | PF07714.24 | PK_Tyr_Ser-Thr | 327 | 595 | 2.5e-95 | 319.4 |
| LXL04_024998 | PF00069.32 | Pkinase | 327 | 594 | 1e-93 | 314.2 |
| LXL04_024998 | PF00069.32 | Pkinase | 953 | 1221 | 1e-93 | 314.2 |
| LXL04_024998 | PF07714.24 | PK_Tyr_Ser-Thr | 954 | 1222 | 2.5e-95 | 319.4 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9C6K9 | 拟南芥 | LEAF RUST 10 DISEASE-RESISTANCE LOCUS RECEPTOR-LIKE PROTEIN KINASE-like 1.1 | 44.164% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
P0C5E2 | 拟南芥 | LEAF RUST 10 DISEASE-RESISTANCE LOCUS RECEPTOR-LIKE PROTEIN KINASE-like 1.2 | 41.483% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q8VYG0 | 拟南芥 | LEAF RUST 10 DISEASE-RESISTANCE LOCUS RECEPTOR-LIKE PROTEIN KINASE-like 1.3 | 60.355% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
F4HQ17 | 拟南芥 | LEAF RUST 10 DISEASE-RESISTANCE LOCUS RECEPTOR-LIKE PROTEIN KINASE-like 1.4 | 59.475% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q8RY67 | 拟南芥 | Wall-associated receptor kinase-like 14 | 47.934% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |