基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_024993
当前版本: OH-1004
染色体: Chr05
坐标: 103602586-103607506
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA2238 bp · LXL04_024993|LXL04_024993|OH1004|cDNA
ATGGCGGCACCACCATCGCCACAACTACCGTCACATCTTCATCTCACACATTTTCTCTTATTCCTACTCCTCCTCTTCCACCTTTCTCTACTCCAGGCTACACCACCGGCTAACGACCACCCAGACCTTTCCCCATTGATGTCATTCAAATCTTCCTCCGACGTCTCAAACAAGCTCACTTCCTGGAACTACTCTTCTGATCCATGTAGCAGCTCTTCTGCCTTCTATGGCGTCTCTTGCCTCCACAACCGAGTTACTCG...
CDS
下载 CDS FASTA2238 bp · LXL04_024993|LXL04_024993|OH1004|CDS
ATGGCGGCACCACCATCGCCACAACTACCGTCACATCTTCATCTCACACATTTTCTCTTATTCCTACTCCTCCTCTTCCACCTTTCTCTACTCCAGGCTACACCACCGGCTAACGACCACCCAGACCTTTCCCCATTGATGTCATTCAAATCTTCCTCCGACGTCTCAAACAAGCTCACTTCCTGGAACTACTCTTCTGATCCATGTAGCAGCTCTTCTGCCTTCTATGGCGTCTCTTGCCTCCACAACCGAGTTACTCG...
745 aa · LXL04_024993|LXL04_024993|OH1004|PROTEIN
MAAPPSPQLPSHLHLTHFLLFLLLLFHLSLLQATPPANDHPDLSPLMSFKSSSDVSNKLTSWNYSSDPCSSSSAFYGVSCLHNRVTRLVLEDLDLQGRFDSLTSLTQLRILSLKRNRLTGPIPDLSKLPSLKLLFLSYNQISGEFPPSLPSLFGLYRLDLSYNNFSGEIPATINRMKHLLTLRLEENQFSGSIGVLSLQNLEDFNISGNQISGEIPTALSGFPESAFTNNRILCGFPLSNCTDPRIPGLASPVGKPANTV...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_024993 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_024993 |
|---|---|
| 位置 | Chr05:103602586-103607506 (-) |
| 描述 | Similar to At1g68400: Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At1g68400 |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0009834 plant-type secondary cell wall biogenesis 生物过程 GO:0005576 extracellular region 细胞组分 GO:0005777 peroxisome 细胞组分 GO:0005829 cytosol 细胞组分 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分 GO:0009506 plasmodesma 细胞组分 GO:0009898 cytoplasmic side of plasma membrane 细胞组分 GO:0016328 lateral plasma membrane 细胞组分 GO:0004672 protein kinase activity 分子功能 GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能 GO:0005524 ATP binding 分子功能 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G68400 ath:AT2G26730 ath:AT2G36570 ath:AT3G08680 ath:AT5G58300 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞膜0.863
内质网0.079
细胞质0.078
细胞核0.065
高尔基体0.020
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF13855.13LRR_8101-141 aaPF23598.2LRR_14101-206 aaPF12799.14LRR_4106-142 aaPF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr383-650 aaPF00069.32Pkinase383-650 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_024993 | PF13855.13 | LRR_8 | 101 | 141 | 1.8e-09 | 37.9 |
| LXL04_024993 | PF23598.2 | LRR_14 | 101 | 206 | 1.1e-06 | 28.4 |
| LXL04_024993 | PF12799.14 | LRR_4 | 106 | 142 | 3.9e-10 | 40.4 |
| LXL04_024993 | PF07714.24 | PK_Tyr_Ser-Thr | 383 | 650 | 4.6e-33 | 115.3 |
| LXL04_024993 | PF00069.32 | Pkinase | 383 | 650 | 1.9e-32 | 113.4 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9M9C5 | 拟南芥 | Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At1g68400 | 63.278% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q9SJQ1 | 拟南芥 | Leucine-rich repeat receptor-like protein kinase PXC1 | 44.562% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
O48788 | 拟南芥 | Probable inactive receptor kinase At2g26730 | 44.874% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q9LVM0 | 拟南芥 | Probable inactive receptor kinase At5g58300 | 43.030% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q9C9Y8 | 拟南芥 | Probable inactive receptor kinase At3g08680 | 42.563% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |