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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_024848
当前版本: OH-1004 染色体: Chr05 坐标: 100409320-100415671 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2658 bp · LXL04_024848|LXL04_024848|OH1004|cDNA

ATGTTGATGGATACGATGTTCGGGGATAGAGGTTGTCGGGGAAGATGCAGATGGTCCGTGGTTATTTTGATTGATCTCAATCGATCAGAAGCTTTAATTTGGGAACGCCCGTCGTTGATTGATAGAATGAGGATCGGATCAACGACAGTGGCTCACAGAGAAAAGGAAAGGCGGAGGAAGGCGGTGGAAGATTCCGATCAGGATGAAGTTGTGGGGGAGGAGTACGTGGTGGAGGACGTGCGAGATCACGATCACGGGAG...

CDS

下载 CDS FASTA

2658 bp · LXL04_024848|LXL04_024848|OH1004|CDS

ATGTTGATGGATACGATGTTCGGGGATAGAGGTTGTCGGGGAAGATGCAGATGGTCCGTGGTTATTTTGATTGATCTCAATCGATCAGAAGCTTTAATTTGGGAACGCCCGTCGTTGATTGATAGAATGAGGATCGGATCAACGACAGTGGCTCACAGAGAAAAGGAAAGGCGGAGGAAGGCGGTGGAAGATTCCGATCAGGATGAAGTTGTGGGGGAGGAGTACGTGGTGGAGGACGTGCGAGATCACGATCACGGGAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

885 aa · LXL04_024848|LXL04_024848|OH1004|PROTEIN

MLMDTMFGDRGCRGRCRWSVVILIDLNRSEALIWERPSLIDRMRIGSTTVAHREKERRRKAVEDSDQDEVVGEEYVVEDVRDHDHGRLAKRRSRFTLLAGDLGLDQNRRVFSRDKFIDGIKGCSPGFYIHPQNSWYRAWEKFILIWAVYSSFFTPMEFGFFRGLPKNLYFLDIAGQLAFLIDVGLHFFIAYRDTQTYKMISNRNLIAVRYLKSHFLFDILACMPWDNIYRASGRKEEVRYLLLLRLVRVRKVLEFFSRLE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_024848
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_024848
位置Chr05:100409320-100415671 (-)
描述Similar to SKOR: Potassium channel SKOR
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g02850 高选择性外向整流钾通道。
Identification and disruption of a plant shaker-like outward channel involved in K+ release into the xylem sap.1998 · DOI: 10.1016/s0092-8674(00)81606-2
At5g37500 保卫细胞膜上的主要选择性向外整流钾通道。
The Arabidopsis outward K+ channel GORK is involved in regulation of stomatal movements and plant transpiration.2003 · DOI: 10.1073/pnas.0733970100
At2g26650 可能作为高选择性内向整流钾通道，介导低 K⁺ 条件下植物根部的钾吸收。
Regulated expression of Arabidopsis shaker K+ channel genes involved in K+ uptake and distribution in the plant.2003 · DOI: 10.1023/a:1022597102282
A protein kinase, interacting with two calcineurin B-like proteins, regulates K+ transporter AKT1 in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1016/j.cell.2006.06.011
A Ca(2)+ signaling pathway regulates a K(+) channel for low-K response in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1073/pnas.0605129103
A protein phosphorylation/dephosphorylation network regulates a plant potassium channel.2007 · DOI: 10.1073/pnas.0707912104
High-affinity K(+) transport in Arabidopsis: AtHAK5 and AKT1 are vital for seedling establishment and postgermination growth under low-potassium conditions.2010 · DOI: 10.1104/pp.110.154369
A role for the AKT1 potassium channel in plant nutrition.1998 · DOI: 10.1126/science.280.5365.918

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os06g0250600 可能的向外整流钾通道。 暂无已核实直接文献
Os04g0445000 可能的向外整流钾通道。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_024848 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006811 monoatomic ion transport 生物过程
GO:0006813 potassium ion transport 生物过程
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009753 response to jasmonic acid 生物过程
GO:0010118 stomatal movement 生物过程
GO:0048767 root hair elongation 生物过程
GO:0051592 response to calcium ion 生物过程
GO:0055075 potassium ion homeostasis 生物过程
GO:0090333 regulation of stomatal closure 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G26650
ath:AT3G02850
ath:AT5G37500
dosa:Os04g0445000
dosa:Os06g0250600
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.696
排名 1 · LXL04_024848 · OH-1004
细胞质0.166
排名 2 · LXL04_024848 · OH-1004
内质网0.116
排名 3 · LXL04_024848 · OH-1004
溶酶体／液泡0.071
排名 4 · LXL04_024848 · OH-1004
高尔基体0.063
排名 5 · LXL04_024848 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00520.38Ion_trans136-386 aa
PF07885.23Ion_trans_2325-382 aa
PF00027.36cNMP_binding476-561 aa
PF13637.13Ank_4610-655 aa
PF12796.14Ank_2610-695 aa
PF13857.13Ank_5621-672 aa
PF00023.37Ank634-666 aa
PF13637.13Ank_4643-683 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_024848PF00520.38Ion_trans1363861.9e-28100.0
LXL04_024848PF07885.23Ion_trans_23253826.6e-0833.0
LXL04_024848PF00027.36cNMP_binding4765611.3e-1867.4
LXL04_024848PF13637.13Ank_46106552.7e-2898.1
LXL04_024848PF12796.14Ank_26106957.3e-2897.7
LXL04_024848PF13857.13Ank_56216724.9e-1968.9
LXL04_024848PF00023.37Ank6346661e-2692.2
LXL04_024848PF13637.13Ank_46436832.7e-2898.1
LXL04_024848PF13637.13Ank_47037522.7e-2898.1
LXL04_024848PF12796.14Ank_27037857.3e-2897.7
LXL04_024848PF13857.13Ank_57197704.9e-1968.9
LXL04_024848PF00023.37Ank7337621e-2692.2
LXL04_024848PF11834.14KHA8098814.1e-1969.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9M8S6拟南芥Potassium channel SKOR68.949%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q94A76拟南芥Potassium channel GORK67.192%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q38998拟南芥Potassium channel AKT134.599%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q653P0水稻Potassium channel KOR166.121%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q7XUW4水稻Potassium channel KOR257.123%Swiss-Prot强数据库同源证据

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