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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_024437
当前版本: OH-1004 染色体: Chr05 坐标: 90580541-90584156 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2913 bp · LXL04_024437|LXL04_024437|OH1004|cDNA

ATGGCGTACATCTTCAATCTTCATTTTCTTTCCCTTTTTCTGTCTTTCACTTTCGCCATTGCTTCCTTCTCCACTAGAGACGCCGCCGTCCTCCTCCGCGTCAAGAACACCCAGCTGGCAGACCCAGATGGCTTACTCAACGACTGGGCCGATTCCCTTACCCCCTGTAATTGGACTGCCATCACTTGCGATAATCGGACACTTGATATTGTTTCAATCGACTTCACCGATTTTGGCAGTCTCGCCGGTCCATTCCCGGC...

CDS

下载 CDS FASTA

2913 bp · LXL04_024437|LXL04_024437|OH1004|CDS

ATGGCGTACATCTTCAATCTTCATTTTCTTTCCCTTTTTCTGTCTTTCACTTTCGCCATTGCTTCCTTCTCCACTAGAGACGCCGCCGTCCTCCTCCGCGTCAAGAACACCCAGCTGGCAGACCCAGATGGCTTACTCAACGACTGGGCCGATTCCCTTACCCCCTGTAATTGGACTGCCATCACTTGCGATAATCGGACACTTGATATTGTTTCAATCGACTTCACCGATTTTGGCAGTCTCGCCGGTCCATTCCCGGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

970 aa · LXL04_024437|LXL04_024437|OH1004|PROTEIN

MAYIFNLHFLSLFLSFTFAIASFSTRDAAVLLRVKNTQLADPDGLLNDWADSLTPCNWTAITCDNRTLDIVSIDFTDFGSLAGPFPADFCRIQTLRYLSIANNYFNGSIPLTSFSLCSHVTFLNISSNVFVGKLPEFQPRFVNLTVLDVSYNNFTGEIPTSIGESLLLEVMDFSANYFSGALPESLTNLTELRTFLGPENPSLSGPLPENIGRLKKLETFRISATNLSGGIPDSIGDLSSIKSIDLSTNSLTGGIPDSIG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_024437
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_024437
位置Chr05:90580541-90584156 (-)
描述Similar to HSL2: LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase HSL2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g65710 参与控制花器官脱落的受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶。 暂无已核实直接文献
At1g28440 类受体蛋白激酶 HSL1。 暂无已核实直接文献
At4g28490 具有双重特异性激酶活性作用于丝氨酸/苏氨酸和酪氨酸底物的受体，控制花器官脱落。 暂无已核实直接文献
At4g28650 参与调控维管组织发育过程中原形成层的维持和极性。
A receptor heteromer mediates the male perception of female attractants in plants.2016 · DOI: 10.1038/nature16975
At1g09970 在病原体相关分子模式 诱导的模式触发免疫 信号传导中发挥作用。
RLK7, a leucine-rich repeat receptor-like kinase, is required for proper germination speed and tolerance to oxidative stress in Arabidopsis thaliana.2010 · DOI: 10.1007/s00425-010-1260-4
The secreted peptide PIP1 amplifies immunity through receptor-like kinase 7.2014 · DOI: 10.1371/journal.ppat.1004331

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_024437 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0009845 seed germination 生物过程
GO:0010067 procambium histogenesis 生物过程
GO:0010087 phloem or xylem histogenesis 生物过程
GO:0010102 lateral root morphogenesis 生物过程
GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程
GO:0010227 floral organ abscission 生物过程
GO:0010468 regulation of gene expression 生物过程
GO:0030154 cell differentiation 生物过程
GO:0045087 innate immune response 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G09970
ath:AT1G28440
ath:AT4G28490
ath:AT4G28650
ath:AT5G65710
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.872
排名 1 · LXL04_024437 · OH-1004
内质网0.086
排名 2 · LXL04_024437 · OH-1004
细胞质0.059
排名 3 · LXL04_024437 · OH-1004
细胞核0.035
排名 4 · LXL04_024437 · OH-1004
溶酶体／液泡0.029
排名 5 · LXL04_024437 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263.18LRRNT_226-64 aa
PF23598.2LRR_14170-345 aa
PF13855.13LRR_8216-270 aa
PF13855.13LRR_8527-585 aa
PF12799.14LRR_4527-566 aa
PF00069.32Pkinase683-899 aa
PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr684-959 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_024437PF08263.18LRRNT_226643.5e-0731.1
LXL04_024437PF23598.2LRR_141703458.7e-2381.4
LXL04_024437PF13855.13LRR_82162705.8e-2690.7
LXL04_024437PF13855.13LRR_85275855.8e-2690.7
LXL04_024437PF12799.14LRR_45275669.4e-2586.8
LXL04_024437PF00069.32Pkinase6838991.1e-43150.2
LXL04_024437PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr6849593.5e-41141.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
C0LGX3拟南芥LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase HSL251.699%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9SGP2拟南芥Receptor-like protein kinase HSL144.213%Swiss-Prot中等数据库同源证据
P47735拟南芥Receptor-like protein kinase 544.513%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9M0G7拟南芥MDIS1-interacting receptor like kinase 139.239%Swiss-Prot中等数据库同源证据
F4I2N7拟南芥Receptor-like protein kinase 739.086%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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