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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_021652
当前版本: OH-1004 染色体: Chr04 坐标: 134265625-134271265 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2547 bp · LXL04_021652|LXL04_021652|OH1004|cDNA

ATGCCTTCATGGTGGAATAGGCCATCATCAAAAGAATCAAAGAAGAAGACAACAAGCAAGGATAGTTTCATAGACACAATTCGCAAGTTTAGAATCTCCTCTGACAAAAAATCATCTGGTTCACGTAGAAATTGCAGTGATACAGTTTCAGAGATCGGGTCTCTATCTAGGATTCAATCCAGATCCGTTTCACcttctaaagaatccaaactTGTGGCAAGATGTCAAAGTTTTCAGGAAAGACCTCAAGCTCAACCACT...

CDS

下载 CDS FASTA

2547 bp · LXL04_021652|LXL04_021652|OH1004|CDS

ATGCCTTCATGGTGGAATAGGCCATCATCAAAAGAATCAAAGAAGAAGACAACAAGCAAGGATAGTTTCATAGACACAATTCGCAAGTTTAGAATCTCCTCTGACAAAAAATCATCTGGTTCACGTAGAAATTGCAGTGATACAGTTTCAGAGATCGGGTCTCTATCTAGGATTCAATCCAGATCCGTTTCACCTTCTAAAGAATCCAAACTTGTGGCAAGATGTCAAAGTTTTCAGGAAAGACCTCAAGCTCAACCACT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

848 aa · LXL04_021652|LXL04_021652|OH1004|PROTEIN

MPSWWNRPSSKESKKKTTSKDSFIDTIRKFRISSDKKSSGSRRNCSDTVSEIGSLSRIQSRSVSPSKESKLVARCQSFQERPQAQPLPLPVLHPSRMTRTESGLSVSKPKHEKGSKTPPFLPLPKTRPDAADFDGADSVFSECYTDSDDPPDSSQLSPLASDYDTGSRTTAGSPSNMLIKDHIPITKRELLPKPHDTHTSSSSPSRPKPLRNHVPNLHIPSHGSFFSAPDSSISSPSRSPLRAFNPEQVLTSAFYTSKPN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_021652
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_021652
位置Chr04:134265625-134271265 (-)
描述Similar to YDA: Mitogen-activated protein kinase kinase kinase YODA
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g63700 在 MAP 激酶级联反应中发挥作用，作为分子开关调节受精卵和早期胚胎的第一次细胞命运决定。 暂无已核实直接文献
At1g53570 丝裂原激活蛋白激酶激酶激酶 3。 暂无已核实直接文献
At5g66850 丝裂原激活蛋白激酶 参与宿主细胞表面几丁质受体复合物 CERK1-LYK5 和细胞内 MAPK 级联之间的信号转导，从而导致几丁质诱导的免疫。
The Arabidopsis CERK1-associated kinase PBL27 connects chitin perception to MAPK activation.2016 · DOI: 10.15252/embj.201694248
At1g54960 通过调控MAP65-1等微管相关蛋白的磷酸化状态，参与皮层微管的组织和稳定。
Arabidopsis homologs of nucleus- and phragmoplast-localized kinase 2 and 3 and mitogen-activated protein kinase 4 are essential for microtubule organization.2010 · DOI: 10.1105/tpc.109.071746
At1g09000 可能参与氧化应激介导的信号级联反应，磷酸化下游 MAP 激酶 MPK3 和 MPK6。
Functional analysis of oxidative stress-activated mitogen-activated protein kinase cascade in plants.2000 · DOI: 10.1073/pnas.97.6.2940
An Arabidopsis mitogen-activated protein kinase kinase kinase gene family encodes essential positive regulators of cytokinesis.2002 · DOI: 10.1105/tpc.001164

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_021652 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000165 MAPK cascade 生物过程
GO:0002221 pattern recognition receptor signaling pathway 生物过程
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0010098 suspensor development 生物过程
GO:0010103 stomatal complex morphogenesis 生物过程
GO:0010229 inflorescence development 生物过程
GO:0043622 cortical microtubule organization 生物过程
GO:0045088 regulation of innate immune response 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:1900150 regulation of defense response to fungus 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G09000
ath:AT1G53570
ath:AT1G54960
ath:AT1G63700
ath:AT5G66850
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.624
排名 1 · LXL04_021652 · OH-1004
细胞核0.281
排名 2 · LXL04_021652 · OH-1004
细胞膜0.256
排名 3 · LXL04_021652 · OH-1004
高尔基体0.042
排名 4 · LXL04_021652 · OH-1004
内质网0.030
排名 5 · LXL04_021652 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069.32Pkinase404-659 aa
PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr405-654 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_021652PF00069.32Pkinase4046592.6e-72244.1
LXL04_021652PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr4056542e-47162.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9CAD5拟南芥Mitogen-activated protein kinase kinase kinase YODA61.453%Swiss-Prot强数据库同源证据
F4HRJ4拟南芥Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 369.349%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9C5H5拟南芥Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 562.222%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9FZ36拟南芥Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 246.130%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
O22040拟南芥Mitogen-activated protein kinase kinase kinase ANP152.222%Swiss-Prot低置信数据库同源证据

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