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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_019904
当前版本: OH-1004 染色体: Chr04 坐标: 43863370-43866675 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3147 bp · LXL04_019904|LXL04_019904|OH1004|cDNA

ATGACGACGATGATTAGGGTTTTATTACTTGCTATGTTCATCATTCCTGCTATAAGTCAGCTTCCTTCCCAAGATATTTTAGCGTTACTCGAATTTAAAAAAGGAATCAAACATGACCCAACTGGGTTCGTTCTAAATTCCTGGAACGAAGAGTCCATCGACTTCAATGGCTGCCCATCTTCCTGGAATGGAATCATGTGCAATGGTGGTAACGTTGCTGGTGTGGTCCTCAACCATCTGTCGCTGTCAGCGGACATTGA...

CDS

下载 CDS FASTA

3147 bp · LXL04_019904|LXL04_019904|OH1004|CDS

ATGACGACGATGATTAGGGTTTTATTACTTGCTATGTTCATCATTCCTGCTATAAGTCAGCTTCCTTCCCAAGATATTTTAGCGTTACTCGAATTTAAAAAAGGAATCAAACATGACCCAACTGGGTTCGTTCTAAATTCCTGGAACGAAGAGTCCATCGACTTCAATGGCTGCCCATCTTCCTGGAATGGAATCATGTGCAATGGTGGTAACGTTGCTGGTGTGGTCCTCAACCATCTGTCGCTGTCAGCGGACATTGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1048 aa · LXL04_019904|LXL04_019904|OH1004|PROTEIN

MTTMIRVLLLAMFIIPAISQLPSQDILALLEFKKGIKHDPTGFVLNSWNEESIDFNGCPSSWNGIMCNGGNVAGVVLNHLSLSADIDLNVFANLTKLVTLSISNNSISGKFPSKLGGMLAFLDISDNLFNSSLPPDIGKMNSLMNLSLAGNSFSGSIPDWISGLSSLKSLDFSRNLFSGPIPPSITTLNNIVYLNLSMNGLTKKIPKGFQDMVALEALDVHGNMLEGDFDPEFLLFTTAIHVDFSGNLLTSSNKDGKFLP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_019904
TK1151 IDTkA05G103900
OH-1004 IDLXL04_019904
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)97.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 96.520 / OH-1004 89.313
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_019904
位置Chr04:43863370-43866675 (+)
描述Similar to GHR1: LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase GHR1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g20940 受体激酶作为脱落酸 信号传导的早期成分。
A plasma membrane receptor kinase, GHR1, mediates abscisic acid- and hydrogen peroxide-regulated stomatal movement in Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1105/tpc.112.100107
A Dominant Mutation in the HT1 Kinase Uncovers Roles of MAP Kinases and GHR1 in CO2-Induced Stomatal Closure.2016 · DOI: 10.1105/tpc.16.00131
Coordinating the overall stomatal response of plants: Rapid leaf-to-leaf communication during light stress.2018 · DOI: 10.1126/scisignal.aam9514
The Receptor-like Pseudokinase GHR1 Is Required for Stomatal Closure.2018 · DOI: 10.1105/tpc.18.00441
At5g10020 可能失活的受体激酶 At5g10020。 暂无已核实直接文献
At5g63930 可能是富含亮氨酸重复的受体样蛋白激酶 At5g63930。 暂无已核实直接文献
At4g36180 可能的 LRR 类似受体丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At4g36180。 暂无已核实直接文献
At3g28040 可能失活的富亮氨酸重复受体样蛋白激酶 At3g28040。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_019904 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009745 sucrose mediated signaling 生物过程
GO:0009789 positive regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0030154 cell differentiation 生物过程
GO:0071244 cellular response to carbon dioxide 生物过程
GO:0071485 cellular response to absence of light 生物过程
GO:0090333 regulation of stomatal closure 生物过程
GO:1905392 plant organ morphogenesis 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G28040
ath:AT4G20940
ath:AT4G36180
ath:AT5G10020
ath:AT5G63930
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.878
排名 1 · LXL04_019904 · OH-1004
内质网0.075
排名 2 · LXL04_019904 · OH-1004
细胞质0.066
排名 3 · LXL04_019904 · OH-1004
细胞核0.048
排名 4 · LXL04_019904 · OH-1004
细胞外0.023
排名 5 · LXL04_019904 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263.18LRRNT_223-68 aa
PF23598.2LRR_1478-171 aa
PF13855.13LRR_8122-176 aa
PF13855.13LRR_8186-225 aa
PF13855.13LRR_8430-489 aa
PF13855.13LRR_8503-562 aa
PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr769-967 aa
PF00069.32Pkinase769-968 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_019904PF08263.18LRRNT_223684e-0937.3
LXL04_019904PF23598.2LRR_14781719.8e-1968.0
LXL04_019904PF13855.13LRR_81221762.2e-41140.1
LXL04_019904PF13855.13LRR_81862252.2e-41140.1
LXL04_019904PF13855.13LRR_84304892.2e-41140.1
LXL04_019904PF13855.13LRR_85035622.2e-41140.1
LXL04_019904PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr7699679.4e-2794.7
LXL04_019904PF00069.32Pkinase7699682.1e-2383.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
C0LGQ9拟南芥LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase GHR165.377%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q0WR59拟南芥Probable inactive receptor kinase At5g1002039.388%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9LVP0拟南芥Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g6393031.724%Swiss-Prot中等数据库同源证据
C0LGS2拟南芥Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g3618028.751%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9LRT1拟南芥Probably inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At3g2804030.684%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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