基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_019032
当前版本: OH-1004
染色体: Chr04
坐标: 22376925-22382492
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA2154 bp · LXL04_019032|LXL04_019032|OH1004|cDNA
ATGGCTCATTGGCTCAAAGCTGCTGAAGATTTGTTTGAAGTTGTAGATCGAAGGGCAAAGCTTGTAGTTGGAGATGAGTTACCAAATTCTTCACAGCCACCAGCTTCCAATGGACAAGGATCTCGAGCAAAGAGTAAAAAGTCAAGAGCAAGGGCTAAAAAGGAAAAACATTTAGATGAAACATTAGTGCCATCTGATAAAGATATACCTACTGCTTCAACCGATAATGATGAAACTAATCATGCTGATTCTTCTTCAAA...
CDS
下载 CDS FASTA2154 bp · LXL04_019032|LXL04_019032|OH1004|CDS
ATGGCTCATTGGCTCAAAGCTGCTGAAGATTTGTTTGAAGTTGTAGATCGAAGGGCAAAGCTTGTAGTTGGAGATGAGTTACCAAATTCTTCACAGCCACCAGCTTCCAATGGACAAGGATCTCGAGCAAAGAGTAAAAAGTCAAGAGCAAGGGCTAAAAAGGAAAAACATTTAGATGAAACATTAGTGCCATCTGATAAAGATATACCTACTGCTTCAACCGATAATGATGAAACTAATCATGCTGATTCTTCTTCAAA...
717 aa · LXL04_019032|LXL04_019032|OH1004|PROTEIN
MAHWLKAAEDLFEVVDRRAKLVVGDELPNSSQPPASNGQGSRAKSKKSRARAKKEKHLDETLVPSDKDIPTASTDNDETNHADSSSKTEDNEQQKVNDVPMSLSSSGDHPQHDTMDSKDPSTAIGEDAPPILNGDTLNRTSSKSGEEISSVPVTLEESESDKSHPIDGGQDVLIKDKGSELVVNKEGSQSLTSDIHSKVNSRKDGNLKIEPQIDEKKNEEDKSVTTTTTTPTKVQDQLESPKKIQDESGSPKKAPDQTGP...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_019032 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_019032 | ||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr04:22376925-22382492 (+) | ||||||||||||
| 描述 | Similar to GC1: Golgin candidate 1 | ||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| ||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0000301 retrograde transport, vesicle recycling within Golgi 生物过程 GO:0007030 Golgi organization 生物过程 GO:0048193 Golgi vesicle transport 生物过程 GO:0000137 Golgi cis cisterna 细胞组分 GO:0000138 Golgi trans cisterna 细胞组分 GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分 GO:0005739 mitochondrion 细胞组分 GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分 GO:0005797 Golgi medial cisterna 细胞组分 GO:0005801 cis-Golgi network 细胞组分 GO:0016020 membrane 细胞组分 GO:0030663 COPI-coated vesicle membrane 细胞组分 | ||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT2G19950 dosa:Os01g0744400 dre:406720 mmu:27277 rno:299258 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
高尔基体0.590
内质网0.207
细胞质0.153
细胞核0.076
细胞膜0.070
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF09787.15Golgin_A5453-689 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_019032 | PF09787.15 | Golgin_A5 | 453 | 689 | 2e-23 | 84.1 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。