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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_018263
当前版本: OH-1004 染色体: Chr04 坐标: 10036933-10038828 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1236 bp · LXL04_018263|LXL04_018263|OH1004|cDNA

ATGTCGTTCAGTCGTTATGCCCTAATCGAAGATTCCATAGTTCCCTATGTCGGTCGCGCTGCCTCTCTGCTAAACTTCACACGCCATACCCATATGTCGACCACCGCTAACGGTTCCGCCGCCGAAAGGCGTACAGCCACCAGCAATGGCCGCAGTCCGGTGGACAAAGAAGTCGACTTCGCCAACTACTTCTGCACATACGCTTTTCTCTTCCACCAAAAAGAGATGCTCTCCGATCGAGTTCGAATGGACGCTTACTA...

CDS

下载 CDS FASTA

1236 bp · LXL04_018263|LXL04_018263|OH1004|CDS

ATGTCGTTCAGTCGTTATGCCCTAATCGAAGATTCCATAGTTCCCTATGTCGGTCGCGCTGCCTCTCTGCTAAACTTCACACGCCATACCCATATGTCGACCACCGCTAACGGTTCCGCCGCCGAAAGGCGTACAGCCACCAGCAATGGCCGCAGTCCGGTGGACAAAGAAGTCGACTTCGCCAACTACTTCTGCACATACGCTTTTCTCTTCCACCAAAAAGAGATGCTCTCCGATCGAGTTCGAATGGACGCTTACTA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

411 aa · LXL04_018263|LXL04_018263|OH1004|PROTEIN

MSFSRYALIEDSIVPYVGRAASLLNFTRHTHMSTTANGSAAERRTATSNGRSPVDKEVDFANYFCTYAFLFHQKEMLSDRVRMDAYYNSVFQNKHHFVGKTVLDVGTGSGILAIWSAQAGARKVYAVEATKMAVHAGELVKSNNLQDVIEVIEGSIEDITLPEKVDVIISEWMGYFLLRESMFDSVIYARDRWLKPNGVMYPSHARMYLAPIRSGLSDHKMRDYEGAMDDWHGFLKETEACYGVNMNVLTKPFSEEQKKY...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_018263
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_018263
位置Chr04:10036933-10038828 (-)
描述Similar to PRMT10: Protein arginine N-methyltransferase PRMT10
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g04870 甲基化某些蛋白质中精氨酰残基的胍基氮。
Crystal structure of the plant epigenetic protein arginine methyltransferase 10.2011 · DOI: 10.1016/j.jmb.2011.09.040

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os06g0142800 甲基化（单二甲基化和不对称二甲基化）某些蛋白质中精氨酰残基的胍基氮。 暂无已核实直接文献
UniProt: A2Y953 甲基化（单二甲基化和不对称二甲基化）某些蛋白质中精氨酰残基的胍基氮。 暂无已核实直接文献
UniProt: A2XYY8 精氨酸甲基转移酶，可催化ω-N 单甲基精氨酸（MMA）和不对称二甲基精氨酸（aDMA）的形成。 暂无已核实直接文献
Os04g0677066 精氨酸甲基转移酶，可催化ω-N 单甲基精氨酸（MMA）和不对称二甲基精氨酸（aDMA）的形成。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_018263 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006338 chromatin remodeling 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0010228 vegetative to reproductive phase transition of meristem 生物过程
GO:0019919 peptidyl-arginine methylation, to asymmetrical-dimethyl arginine 生物过程
GO:0032259 methylation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0016274 protein-arginine N-methyltransferase activity 分子功能
GO:0035241 protein-arginine omega-N monomethyltransferase activity 分子功能
GO:0035242 protein-arginine omega-N asymmetric methyltransferase activity 分子功能
GO:0042054 histone methyltransferase activity 分子功能
GO:0044020 histone H4R3 methyltransferase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G04870
dosa:Os06g0142800
osa:9268644
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.602
排名 1 · LXL04_018263 · OH-1004
细胞核0.450
排名 2 · LXL04_018263 · OH-1004
线粒体0.090
排名 3 · LXL04_018263 · OH-1004
细胞膜0.043
排名 4 · LXL04_018263 · OH-1004
内质网0.041
排名 5 · LXL04_018263 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF05175.21MTS98-170 aa
PF06325.20PrmA99-171 aa
PF13847.13Methyltransf_3199-206 aa
PF13649.13Methyltransf_25102-198 aa
PF08241.19Methyltransf_11103-200 aa
PF22528.2PRMT_C205-394 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_018263PF05175.21MTS981704e-0730.5
LXL04_018263PF06325.20PrmA991711.5e-1248.4
LXL04_018263PF13847.13Methyltransf_31992061e-0732.6
LXL04_018263PF13649.13Methyltransf_251021982.9e-0938.2
LXL04_018263PF08241.19Methyltransf_111032007.9e-0936.8
LXL04_018263PF22528.2PRMT_C2053949.6e-2381.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9MAT5拟南芥Protein arginine N-methyltransferase PRMT1066.944%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9SNQ2水稻Protein arginine N-methyltransferase PRMT1065.084%Swiss-Prot强数据库同源证据
A2Y953水稻Protein arginine N-methyltransferase PRMT1065.084%Swiss-Prot强数据库同源证据
A2XYY8水稻Probable protein arginine N-methyltransferase 6.136.390%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q7XKC0水稻Probable protein arginine N-methyltransferase 6.136.390%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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