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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_017125
当前版本: OH-1004 染色体: Chr03 坐标: 141545990-141552541 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2961 bp · LXL04_017125|LXL04_017125|OH1004|cDNA

ATGTCGTTAAAAGCTATAAACCTTGAGAAAGTCAAAACCCATGTCTCAAACCCAAAAGTATGGATCGTGATCGGCGTCAGCGTCGCCGGCATATTGATCCTCACCGCAGAGACTCGGAGGCGCCGATTAAAAGGTAGGTATGCGATAAAAGAAGACTATGGTGCTTTTATAGAGCGGTTCGAGTTACTTCCATTTCCTCAGCCGCCTCCTCCCGCCGCAAAACAGCCTCTTTCTGGCCTAACTTTCGCCATCAGCGACGT...

CDS

下载 CDS FASTA

2961 bp · LXL04_017125|LXL04_017125|OH1004|CDS

ATGTCGTTAAAAGCTATAAACCTTGAGAAAGTCAAAACCCATGTCTCAAACCCAAAAGTATGGATCGTGATCGGCGTCAGCGTCGCCGGCATATTGATCCTCACCGCAGAGACTCGGAGGCGCCGATTAAAAGGTAGGTATGCGATAAAAGAAGACTATGGTGCTTTTATAGAGCGGTTCGAGTTACTTCCATTTCCTCAGCCGCCTCCTCCCGCCGCAAAACAGCCTCTTTCTGGCCTAACTTTCGCCATCAGCGACGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

986 aa · LXL04_017125|LXL04_017125|OH1004|PROTEIN

MSLKAINLEKVKTHVSNPKVWIVIGVSVAGILILTAETRRRRLKGRYAIKEDYGAFIERFELLPFPQPPPPAAKQPLSGLTFAISDVFDVKEYVTGFGNPDWKRTHEEAGKTAIVVTTLLKDGATCVGRTVMDELSFGTTGENSHYGTPTSPAMPSYIPGGSSSGSAVAVAAELVDFSIGTDTLGGVRIPASFCGVLGFRPSHGVVSTIGVLPNSQSLDTVGIFARDPSVLHRVGHVLLRLNPLEPRRTKRIIVADDLFQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_017125
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_017125
位置Chr03:141545990-141552541 (+)
描述Similar to OM64: Outer envelope protein 64, mitochondrial
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g09420 分子伴侣受体，介导Hsp90依赖的蛋白质靶向到线粒体。 暂无已核实直接文献
At3g17970 伴侣受体介导 Hsp90 依赖性蛋白靶向叶绿体。
Toc64/OEP64 is not essential for the efficient import of proteins into chloroplasts in Arabidopsis thaliana.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03207.x
At1g08980 酰胺酶参与生长素生物合成。
Molecular cloning and characterization of an amidase from Arabidopsis thaliana capable of converting indole-3-acetamide into the plant growth hormone, indole-3-acetic acid.2003 · DOI: 10.1016/s0031-9422(02)00563-0
Characterization of Four Bifunctional Plant IAM/PAM-Amidohydrolases Capable of Contributing to Auxin Biosynthesis.2014 · DOI: 10.3390/plants3030324

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0118100 参与生长素生物合成的酰胺酶（可能性）。
Characterization of Four Bifunctional Plant IAM/PAM-Amidohydrolases Capable of Contributing to Auxin Biosynthesis.2014 · DOI: 10.3390/plants3030324
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017125 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006626 protein targeting to mitochondrion 生物过程
GO:0009684 indoleacetic acid biosynthetic process 生物过程
GO:0009851 auxin biosynthetic process 生物过程
GO:0015031 protein transport 生物过程
GO:0030150 protein import into mitochondrial matrix 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005741 mitochondrial outer membrane 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G08980
ath:AT3G17970
ath:AT5G09420
dosa:Os04g0118100
osa:4334958
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.346
排名 1 · LXL04_017125 · OH-1004
细胞质0.345
排名 2 · LXL04_017125 · OH-1004
细胞核0.231
排名 3 · LXL04_017125 · OH-1004
过氧化物酶体0.105
排名 4 · LXL04_017125 · OH-1004
细胞膜0.076
排名 5 · LXL04_017125 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01425.27Amidase73-460 aa
PF25575.1TPR_BSK1_C492-559 aa
PF00515.35TPR_1494-526 aa
PF07719.24TPR_2494-526 aa
PF13414.13TPR_11500-541 aa
PF07719.24TPR_2528-560 aa
PF00515.35TPR_1529-560 aa
PF28509.1DUF8418665-703 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_017125PF01425.27Amidase734601.7e-57196.1
LXL04_017125PF25575.1TPR_BSK1_C4925599.1e-0626.3
LXL04_017125PF00515.35TPR_14945261.1e-1557.4
LXL04_017125PF07719.24TPR_24945262.6e-1349.7
LXL04_017125PF13414.13TPR_115005412.4e-1040.7
LXL04_017125PF07719.24TPR_25285602.6e-1349.7
LXL04_017125PF00515.35TPR_15295601.1e-1557.4
LXL04_017125PF28509.1DUF84186657034.5e-1865.4
LXL04_017125PF04827.21Plant_tran7738465.4e-39134.7
LXL04_017125PF13359.13DDE_Tnp_47799085.4e-1246.3
LXL04_017125PF04827.21Plant_tran8469165.4e-39134.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4KCL7拟南芥Outer envelope protein 64, mitochondrial64.333%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9LVH5拟南芥Outer envelope protein 64, chloroplastic53.901%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9FR37拟南芥Amidase 151.300%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q7XTK3水稻Amidase 147.518%Swiss-Prot低置信数据库同源证据

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