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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_017057
当前版本: OH-1004 染色体: Chr03 坐标: 140253323-140257501 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1830 bp · LXL04_017057|LXL04_017057|OH1004|cDNA

ATGAGAATCTTGGCTTTTAGCTTGCAAGAAATGGATAAGACCCTCCCTCGGATCCTCTGTTGGTTTATTTTTGGTTTCTATAATTTGTCAAGTGTTTATGGGAATGAAGTTGAAGCATTGACTGCCCTGAAGGCCCAATTACATGATTATGATTCTAGTGTTTTGCAAAGTTGGGATCCGGCCCTTTCCATTCCATGTACTTGGTTTCATGTTACTTGCGACAATGAGAATAAAGTTATTCGAATTGATCTTGGAAACGC...

CDS

下载 CDS FASTA

1830 bp · LXL04_017057|LXL04_017057|OH1004|CDS

ATGAGAATCTTGGCTTTTAGCTTGCAAGAAATGGATAAGACCCTCCCTCGGATCCTCTGTTGGTTTATTTTTGGTTTCTATAATTTGTCAAGTGTTTATGGGAATGAAGTTGAAGCATTGACTGCCCTGAAGGCCCAATTACATGATTATGATTCTAGTGTTTTGCAAAGTTGGGATCCGGCCCTTTCCATTCCATGTACTTGGTTTCATGTTACTTGCGACAATGAGAATAAAGTTATTCGAATTGATCTTGGAAACGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

609 aa · LXL04_017057|LXL04_017057|OH1004|PROTEIN

MRILAFSLQEMDKTLPRILCWFIFGFYNLSSVYGNEVEALTALKAQLHDYDSSVLQSWDPALSIPCTWFHVTCDNENKVIRIDLGNAGLSGQLVPELGQLTNLQYLELYSNNITGKIPYELGNLTNLVSLDLYLNQLDGDIPDTLGKLHKLRYLRLNDNNLTGTIPNSLTTIDELQILDLSNTFLKGDVPFNGSFVRFTPISFNNTNVTFPQDTTPPYSPSPSAGNNIGAIAGGVATGAALLTAIALSWWRHRNSQYHFS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_017057
TK1151 IDTkA02G077750
OH-1004 IDLXL04_017057
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)97.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_017057
位置Chr03:140253323-140257501 (+)
描述Similar to BAK1: BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1-associated receptor kinase 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g33430 双特异性激酶作用于含丝氨酸/苏氨酸和含酪氨酸的底物。
The BRI1-associated kinase 1, BAK1, has a brassinolide-independent role in plant cell-death control.2007 · DOI: 10.1016/j.cub.2007.05.046
BAK1 and BKK1 regulate brassinosteroid-dependent growth and brassinosteroid-independent cell-death pathways.2007 · DOI: 10.1016/j.cub.2007.05.036
Arabidopsis SOMATIC EMBRYOGENESIS RECEPTOR KINASE proteins serve brassinosteroid-dependent and -independent signaling pathways.2008 · DOI: 10.1104/pp.108.123216
Tyrosine phosphorylation of the BRI1 receptor kinase emerges as a component of brassinosteroid signaling in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1073/pnas.0810249106
Phosphorylation of receptor-like cytoplasmic kinases by bacterial flagellin.2010 · DOI: 10.4161/psb.11500
The Arabidopsis leucine-rich repeat receptor-like kinases BAK1/SERK3 and BKK1/SERK4 are required for innate immunity to hemibiotrophic and biotrophic pathogens.2011 · DOI: 10.1105/tpc.111.084301
Structure of the pseudokinase domain of BIR2, a regulator of BAK1-mediated immune signaling in Arabidopsis.2014 · DOI: 10.1016/j.jsb.2014.02.005
Phytosulfokine Regulates Growth in Arabidopsis through a Response Module at the Plasma Membrane That Includes CYCLIC NUCLEOTIDE-GATED CHANNEL17, H+-ATPase, and BAK1.2015 · DOI: 10.1105/tpc.15.00306
An RLP23-SOBIR1-BAK1 complex mediates NLP-triggered immunity.2015 · DOI: 10.1038/nplants.2015.140
The SCOOP12 peptide regulates defense response and root elongation in Arabidopsis thaliana.2019 · DOI: 10.1093/jxb/ery454
The Arabidopsis MIK2 receptor elicits immunity by sensing a conserved signature from phytocytokines and microbes.2021 · DOI: 10.1038/s41467-021-25580-w
At1g71830 双特异性激酶作用于含丝氨酸/苏氨酸和含酪氨酸的底物。
Role of threonines in the Arabidopsis thaliana somatic embryogenesis receptor kinase 1 activation loop in phosphorylation.2001 · DOI: 10.1074/jbc.m102381200
In vivo hexamerization and characterization of the Arabidopsis AAA ATPase CDC48A complex using forster resonance energy transfer-fluorescence lifetime imaging microscopy and fluorescence correlation spectroscopy.2007 · DOI: 10.1104/pp.107.103986

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: B8BB68 参与防御反应的 LRR 受体激酶。 暂无已核实直接文献
Os08g0174700 LRR 受体激酶参与防御反应。
Engineering OsBAK1 gene as a molecular tool to improve rice architecture for high yield.2009 · DOI: 10.1111/j.1467-7652.2009.00444.x
A subset of OsSERK genes, including OsBAK1, affects normal growth and leaf development of rice.2011 · DOI: 10.1007/s10059-011-0178-4
Os04g0457800 LRR 受体激酶参与体细胞胚胎发生的正向调节和对稻瘟病菌病原体 Magnaporthe oryzae 的防御反应。
Rice SERK1 gene positively regulates somatic embryogenesis of cultured cell and host defense response against fungal infection.2005 · DOI: 10.1007/s00425-005-1534-4
An XA21-associated kinase (OsSERK2) regulates immunity mediated by the XA21 and XA3 immune receptors.2014 · DOI: 10.1093/mp/ssu003
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017057 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002229 defense response to oomycetes 生物过程
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0007030 Golgi organization 生物过程
GO:0009556 microsporogenesis 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程
GO:0010152 pollen maturation 生物过程
GO:0010227 floral organ abscission 生物过程
GO:0010262 somatic embryogenesis 生物过程
GO:0030154 cell differentiation 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G71830
ath:AT4G33430
dosa:Os04g0457800
dosa:Os08g0174700
osa:4336035
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.868
排名 1 · LXL04_017057 · OH-1004
内质网0.083
排名 2 · LXL04_017057 · OH-1004
细胞质0.075
排名 3 · LXL04_017057 · OH-1004
细胞核0.048
排名 4 · LXL04_017057 · OH-1004
溶酶体／液泡0.026
排名 5 · LXL04_017057 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263.18LRRNT_235-74 aa
PF23598.2LRR_1489-181 aa
PF12799.14LRR_4101-140 aa
PF13855.13LRR_8139-183 aa
PF00069.32Pkinase292-559 aa
PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr293-563 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_017057PF08263.18LRRNT_235742.3e-0938.1
LXL04_017057PF23598.2LRR_14891812.1e-1040.6
LXL04_017057PF12799.14LRR_41011403.6e-0937.3
LXL04_017057PF13855.13LRR_81391833.1e-0937.2
LXL04_017057PF00069.32Pkinase2925595.8e-40138.1
LXL04_017057PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr2935635.4e-42144.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q94F62拟南芥BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1-associated receptor kinase 168.482%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q94AG2拟南芥Somatic embryogenesis receptor kinase 167.613%Swiss-Prot强数据库同源证据
B8BB68水稻LRR receptor kinase BAK167.095%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q6Z4U4水稻LRR receptor kinase BAK168.781%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q7XV05水稻LRR receptor kinase SERK267.391%Swiss-Prot强数据库同源证据

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