基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_016429
当前版本: OH-1004
染色体: Chr03
坐标: 122857736-122868475
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA2514 bp · LXL04_016429|LXL04_016429|OH1004|cDNA
ATGATTAGGACACGATTGGATGAGAAGTGGTCATGGTTGACGGCATCAATGGCGGAAGAAGGACGAGTTACCAAGTTTTGGTTTGCTATCGTTGTACTTTCTGCAGTGATAACTTGTACCACGGCGGTAGACACCATCCACGCAGGCCAAACCATTAAAGACGGCGAAACCATCGTTTCAGCTCAAGACAGCTTCGAGCTTGGTTTCTTCAGCCCCGTAAACTCCAGAAACAGGTATGTCGGTATCTGGTACAAGAGAAT...
CDS
下载 CDS FASTA2514 bp · LXL04_016429|LXL04_016429|OH1004|CDS
ATGATTAGGACACGATTGGATGAGAAGTGGTCATGGTTGACGGCATCAATGGCGGAAGAAGGACGAGTTACCAAGTTTTGGTTTGCTATCGTTGTACTTTCTGCAGTGATAACTTGTACCACGGCGGTAGACACCATCCACGCAGGCCAAACCATTAAAGACGGCGAAACCATCGTTTCAGCTCAAGACAGCTTCGAGCTTGGTTTCTTCAGCCCCGTAAACTCCAGAAACAGGTATGTCGGTATCTGGTACAAGAGAAT...
837 aa · LXL04_016429|LXL04_016429|OH1004|PROTEIN
MIRTRLDEKWSWLTASMAEEGRVTKFWFAIVVLSAVITCTTAVDTIHAGQTIKDGETIVSAQDSFELGFFSPVNSRNRYVGIWYKRISNRTVVWVANRNTPLTNTSGELSLTLQGTLVIRSATGNVIWSVTNSSVGNPIGRLLDTGNFIIMNGEDLENPVWQSFDFPTDTFLPGMKFGKDLITGLERRFTSWKNDGDPSDGEFTVSIDTQGYPQMVVREGSDIVFRAGPWNGVRFTGTPNLKPNSIYRFGFVLDQKEMYY...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_016429 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_016429 |
|---|---|
| 位置 | Chr03:122857736-122868475 (-) |
| 描述 | Similar to At4g27290: G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g27290 |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程 GO:0006955 immune response 生物过程 GO:0007165 signal transduction 生物过程 GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程 GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程 GO:0048544 recognition of pollen 生物过程 GO:0071215 cellular response to abscisic acid stimulus 生物过程 GO:0005576 extracellular region 细胞组分 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005773 vacuole 细胞组分 GO:0005829 cytosol 细胞组分 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G65790 ath:AT1G65800 ath:AT4G21380 ath:AT4G27290 ath:AT4G27300 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞膜0.869
内质网0.077
细胞质0.067
细胞核0.033
溶酶体／液泡0.026
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF01453.31B_lectin91-193 aaPF00954.26S_locus_glycop225-333 aaPF08276.18PAN_2355-421 aaPF00069.32Pkinase520-785 aaPF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr522-788 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_016429 | PF01453.31 | B_lectin | 91 | 193 | 2.8e-33 | 115.2 |
| LXL04_016429 | PF00954.26 | S_locus_glycop | 225 | 333 | 1.2e-30 | 107.1 |
| LXL04_016429 | PF08276.18 | PAN_2 | 355 | 421 | 1.2e-19 | 70.9 |
| LXL04_016429 | PF00069.32 | Pkinase | 520 | 785 | 4.3e-45 | 154.9 |
| LXL04_016429 | PF07714.24 | PK_Tyr_Ser-Thr | 522 | 788 | 1.6e-49 | 169.3 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
O81832 | 拟南芥 | G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g27290 | 50.798% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
O81905 | 拟南芥 | Receptor-like serine/threonine-protein kinase SD1-8 | 47.052% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
O81833 | 拟南芥 | G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SD1-1 | 47.407% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q9S972 | 拟南芥 | Receptor-like serine/threonine-protein kinase SD1-6 | 46.022% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q39086 | 拟南芥 | Receptor-like serine/threonine-protein kinase SD1-7 | 44.920% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |