LXL04_016151 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_016151

当前版本: OH-1004 染色体: Chr03 坐标: 112296471-112297980 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

757 bp · LXL04_016151|LXL04_016151|OH1004|cDNA

ATGGATGATTCTTTGCCACTTGATAAGTTATCATTGGAGTCCACTGAGGAAAATAGTTCATCACATCCAAACACAAAGAGGAAAGTCCACATAGTACTGGTGTCAACCGGAAGCTTCAATCCTCCTACCTTCATGCATTTACGACTATTTGAATTGGCAAGGGATGCACTTAACTCAAAAGGGTATAATGTTGTTGGAGGTTATATGTCGCCTGTAAACCATGCATACCAGAAAAAGGGTCTCATACCATCCGAACATCG...

CDS

下载 CDS FASTA

753 bp · LXL04_016151|LXL04_016151|OH1004|CDS

ATGGATGATTCTTTGCCACTTGATAAGTTATCATTGGAGTCCACTGAGGAAAATAGTTCATCACATCCAAACACAAAGAGGAAAGTCCACATAGTACTGGTGTCAACCGGAAGCTTCAATCCTCCTACCTTCATGCATTTACGACTATTTGAATTGGCAAGGGATGCACTTAACTCAAAAGGGTATAATGTTGTTGGAGGTTATATGTCGCCTGTAAACCATGCATACCAGAAAAAGGGTCTCATACCATCCGAACATCG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

250 aa · LXL04_016151|LXL04_016151|OH1004|PROTEIN

MDDSLPLDKLSLESTEENSSSHPNTKRKVHIVLVSTGSFNPPTFMHLRLFELARDALNSKGYNVVGGYMSPVNHAYQKKGLIPSEHRITMCQLACKSSDFVMVDSWEAKQTSFQRSLTVLSRIRSFFCDNGLIPTGSLKVMLVCGSDLLGSFGIPGAWIPDHIRIICRDYGVVCIRREGQDIEKIISRDDILTEYKSNIEVVDELVPNRISSTLVRDCVSRGLSVKYLTSDEVIDYIKRNQLYTNQERNS

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_016151`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_016151

位置 Chr03:112296471-112297980 (+)

描述 Similar to NMNAT: Nicotinamide/nicotinic acid mononucleotide adenylyltransferase

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g55810`	催化从烟酰胺单核苷酸（NMN）和ATP形成NAD(+)。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os02g0814900`	催化从烟酰胺单核苷酸（NMN）和ATP形成NAD(+)。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_016151 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009165 nucleotide biosynthetic process 生物过程

GO:0009435 NAD+ biosynthetic process 生物过程

GO:0009555 pollen development 生物过程

GO:0009611 response to wounding 生物过程

GO:0009860 pollen tube growth 生物过程

GO:0034355 NAD+ biosynthetic process via the salvage pathway 生物过程

GO:0043410 positive regulation of MAPK cascade 生物过程

GO:0045892 negative regulation of DNA-templated transcription 生物过程

GO:1990966 ATP generation from poly-ADP-D-ribose 生物过程

GO:0000785 chromatin 细胞组分

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT5G55810

bta:522863

dosa:Os02g0814900

hsa:64802

mmu:66454

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.641

排名 1 · LXL04_016151 · OH-1004

细胞核0.555

排名 2 · LXL04_016151 · OH-1004

线粒体0.072

排名 3 · LXL04_016151 · OH-1004

过氧化物酶体0.037

排名 4 · LXL04_016151 · OH-1004

细胞膜0.031

排名 5 · LXL04_016151 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01467.33CTP_transf_like36-216 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_016151	`PF01467.33`	CTP_transf_like	36	216	8.1e-17	62.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`F4K687`	拟南芥	Nicotinamide/nicotinic acid mononucleotide adenylyltransferase	62.705%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q0DWH7`	水稻	Nicotinamide/nicotinic acid mononucleotide adenylyltransferase	59.671%	Swiss-Prot	强数据库同源证据

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