基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_016140
当前版本: OH-1004
染色体: Chr03
坐标: 112104016-112108087
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1233 bp · LXL04_016140|LXL04_016140|OH1004|cDNA
ATGAATAAGATGAACAAAAGAGGCGGATTCAGTGCTCGTCGGCCGCTGCTTGCTGGCGAGGAGAATAACGAACAGCAGAGGCGGCGTTGGAGAAGAGGGCCGCTGGTTGCGGCGAGAAGAAGCGGTGCGCTGGCGTCGGAGGTGCGAGAGACAGCCGCCGGAGATGGGAAGGAGATTGATCGTCACAGAAGGAGGGAAATGGTGATCATAACCCAGGATATGATAAAGCAATTCCAGAGCTTGATAGAAGCAATCGACGA...
CDS
下载 CDS FASTA1233 bp · LXL04_016140|LXL04_016140|OH1004|CDS
ATGAATAAGATGAACAAAAGAGGCGGATTCAGTGCTCGTCGGCCGCTGCTTGCTGGCGAGGAGAATAACGAACAGCAGAGGCGGCGTTGGAGAAGAGGGCCGCTGGTTGCGGCGAGAAGAAGCGGTGCGCTGGCGTCGGAGGTGCGAGAGACAGCCGCCGGAGATGGGAAGGAGATTGATCGTCACAGAAGGAGGGAAATGGTGATCATAACCCAGGATATGATAAAGCAATTCCAGAGCTTGATAGAAGCAATCGACGA...
410 aa · LXL04_016140|LXL04_016140|OH1004|PROTEIN
MNKMNKRGGFSARRPLLAGEENNEQQRRRWRRGPLVAARRSGALASEVRETAAGDGKEIDRHRRREMVIITQDMIKQFQSLIEAIDEPIKIAYENLHQGCPTETMIRFLKARDGNIPKAHKMLVDCLNWRIENQIDKILSKPIVPVELYRSVRESQLIGMSGYTKDGRPVIAVGVGLSTYDKASIHSYVQSHIQINEFRDRVIMPSATKKYERQISTCVKVLDMTGLKLSHLNQIKLLTVISSIDDLNYPEKTDTYYIVN...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_016140 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_016140 | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr03:112104016-112108087 (+) | ||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to SFH2: Phosphatidylinositol/phosphatidylcholine transfer protein SFH2 | ||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | ||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006656 phosphatidylcholine biosynthetic process 生物过程 GO:0006892 post-Golgi vesicle-mediated transport 生物过程 GO:0009908 flower development 生物过程 GO:0009932 cell tip growth 生物过程 GO:0010053 root epidermal cell differentiation 生物过程 GO:0015031 protein transport 生物过程 GO:0048767 root hair elongation 生物过程 GO:0048768 root hair cell tip growth 生物过程 GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分 GO:0005739 mitochondrion 细胞组分 GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 | ||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT2G21520 ath:AT2G21540 ath:AT4G34580 ath:AT4G36490 ath:AT4G39180 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞质0.440
细胞核0.265
细胞膜0.204
线粒体0.117
内质网0.107
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF03765.22CRAL_TRIO_N75-125 aaPF00650.26CRAL_TRIO154-307 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_016140 | PF03765.22 | CRAL_TRIO_N | 75 | 125 | 3.8e-09 | 37.3 |
| LXL04_016140 | PF00650.26 | CRAL_TRIO | 154 | 307 | 7.2e-23 | 81.8 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
F4JVA9 | 拟南芥 | Phosphatidylinositol/phosphatidylcholine transfer protein SFH2 | 32.636% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q93ZE9 | 拟南芥 | Phosphatidylinositol/phosphatidylcholine transfer protein SFH3 | 30.962% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q94A34 | 拟南芥 | Phosphatidylinositol/phosphatidylcholine transfer protein SFH12 | 30.038% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
F4JLE5 | 拟南芥 | Phosphatidylinositol/phosphatidylcholine transfer protein SFH1 | 30.213% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
F4IHJ0 | 拟南芥 | Phosphatidylinositol/phosphatidylcholine transfer protein SFH8 | 30.081% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |