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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_015006
当前版本: OH-1004 染色体: Chr03 坐标: 61338368-61342499 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1851 bp · LXL04_015006|LXL04_015006|OH1004|cDNA

ATGGCTGCCAGTCTAACAACCCTCCAATTTCCCTCTCCATATCTGAAATCCCACCACTCTCATACCGTGAAATTCAAGCTCAAATCTGCTCCGATTGCCAATCCGAATGGGAGCTCACGGAGTTGTGGGATTAAATGCTCGTATTCAAATGGGAGAAAGCCTGATTCGAGTAGCGACGAAAAGAGCGGCAAGAGCTTGGAGGCGCTACGAGAAGAGAAACGGCGGGCGGAGTTATCGGCGCGAATTGCTTCAGGCGAATT...

CDS

下载 CDS FASTA

1851 bp · LXL04_015006|LXL04_015006|OH1004|CDS

ATGGCTGCCAGTCTAACAACCCTCCAATTTCCCTCTCCATATCTGAAATCCCACCACTCTCATACCGTGAAATTCAAGCTCAAATCTGCTCCGATTGCCAATCCGAATGGGAGCTCACGGAGTTGTGGGATTAAATGCTCGTATTCAAATGGGAGAAAGCCTGATTCGAGTAGCGACGAAAAGAGCGGCAAGAGCTTGGAGGCGCTACGAGAAGAGAAACGGCGGGCGGAGTTATCGGCGCGAATTGCTTCAGGCGAATT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

616 aa · LXL04_015006|LXL04_015006|OH1004|PROTEIN

MAASLTTLQFPSPYLKSHHSHTVKFKLKSAPIANPNGSSRSCGIKCSYSNGRKPDSSSDEKSGKSLEALREEKRRAELSARIASGEFTVEKPSSFGSLLVNSLTKLGVPSEFLESLSQLINLDDKYPKIPEAKGAISAIRSEAFFIPLYELFLTYGGIFRLTFGPKSFLIVSDPIIAKRILKDNAKAYSKGILAEILEFVMGTGLIPADGEVWRVRRRVIVPALHLKYVAAMIGLFGEATDRLCKKLDAAAYNGEDVEME...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_015006
TK1151 IDTkA02G378150
OH-1004 IDLXL04_015006
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_015006
位置Chr03:61338368-61342499 (-)
描述Similar to CYP97A3: Protein LUTEIN DEFICIENT 5, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g31800 含血红素的细胞色素 P450 参与叶黄素的生物合成。
Defining the primary route for lutein synthesis in plants: the role of Arabidopsis carotenoid beta-ring hydroxylase CYP97A3.2006 · DOI: 10.1073/pnas.0511207103
Elucidation of the beta-carotene hydroxylation pathway in Arabidopsis thaliana.2006 · DOI: 10.1016/j.febslet.2006.07.055
The evolution and function of carotenoid hydroxylases in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1093/pcp/pcp005
At3g53130 含血红素的细胞色素 P450 参与叶黄素的生物合成。
Functional analysis of beta- and epsilon-ring carotenoid hydroxylases in Arabidopsis.2003 · DOI: 10.1105/tpc.011403
Elucidation of the beta-carotene hydroxylation pathway in Arabidopsis thaliana.2006 · DOI: 10.1016/j.febslet.2006.07.055
The evolution and function of carotenoid hydroxylases in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1093/pcp/pcp005
Over-expression of Arabidopsis thaliana carotenoid hydroxylases individually and in combination with a beta-carotene ketolase provides insight into in vivo functions.2010 · DOI: 10.1016/j.phytochem.2009.10.011
A quadruple mutant of Arabidopsis reveals a β-carotene hydroxylation activity for LUT1/CYP97C1 and a regulatory role of xanthophylls on determination of the PSI/PSII ratio.2012 · DOI: 10.1186/1471-2229-12-50
At4g15110 含血红素的细胞色素 P450 可能参与叶黄素的生物合成。
Over-expression of Arabidopsis thaliana carotenoid hydroxylases individually and in combination with a beta-carotene ketolase provides insight into in vivo functions.2010 · DOI: 10.1016/j.phytochem.2009.10.011

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_015006 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0016117 carotenoid biosynthetic process 生物过程
GO:0016123 xanthophyll biosynthetic process 生物过程
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009570 chloroplast stroma 细胞组分
GO:0009941 chloroplast envelope 细胞组分
GO:0031969 chloroplast membrane 细胞组分
GO:0004497 monooxygenase activity 分子功能
GO:0005506 iron ion binding 分子功能
GO:0010291 beta-carotene 3-hydroxylase activity 分子功能
GO:0016705 oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen 分子功能
GO:0020037 heme binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G31800
ath:AT3G53130
ath:AT4G15110
gmx:606504
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.982
排名 1 · LXL04_015006 · OH-1004
线粒体0.023
排名 2 · LXL04_015006 · OH-1004
细胞质0.015
排名 3 · LXL04_015006 · OH-1004
过氧化物酶体0.013
排名 4 · LXL04_015006 · OH-1004
细胞膜0.012
排名 5 · LXL04_015006 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00067.28p450148-569 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_015006PF00067.28p4501485695.8e-87293.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q93VK5拟南芥Protein LUTEIN DEFICIENT 5, chloroplastic80.183%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q6TBX7拟南芥Carotene epsilon-monooxygenase, chloroplastic53.363%Swiss-Prot强数据库同源证据
O23365拟南芥Cytochrome P450 97B3, chloroplastic43.636%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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