LXL04_015002 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_015002

当前版本: OH-1004 染色体: Chr03 坐标: 61303534-61306711 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2130 bp · LXL04_015002|LXL04_015002|OH1004|cDNA

ATGAATTGTTTGCCATGCCTTAGAAAGAAGAAACCCGATGGAAAGAAGAAAACCGATGGAAAGAAAGAAGATAAGAAGGAAGATAAGAAGGAAGATGGGGAGTTGCCTGTGGCACAACCTAAAGTCAATCCCCTATCAAAACAACCTACCCTATCAAAAGTACCTACTGTGAAAATCACCGGTTCAAACAAAAAATATGATTCATACAAACAAAACAATCTAAGCAAACAAGACAATTTAAACAAACAAGAGCAAATTGT...

CDS

下载 CDS FASTA

2130 bp · LXL04_015002|LXL04_015002|OH1004|CDS

ATGAATTGTTTGCCATGCCTTAGAAAGAAGAAACCCGATGGAAAGAAGAAAACCGATGGAAAGAAAGAAGATAAGAAGGAAGATAAGAAGGAAGATGGGGAGTTGCCTGTGGCACAACCTAAAGTCAATCCCCTATCAAAACAACCTACCCTATCAAAAGTACCTACTGTGAAAATCACCGGTTCAAACAAAAAATATGATTCATACAAACAAAACAATCTAAGCAAACAAGACAATTTAAACAAACAAGAGCAAATTGT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

709 aa · LXL04_015002|LXL04_015002|OH1004|PROTEIN

MNCLPCLRKKKPDGKKKTDGKKEDKKEDKKEDGELPVAQPKVNPLSKQPTLSKVPTVKITGSNKKYDSYKQNNLSKQDNLNKQEQIVDIDDGVVGSTTVAVPVVTPTPYQPPEDPTGTYRFHELTAATKNFNKECLLGESAFGKVYKGTLPDGKIVAVKQLDKNGFKANKEFLEEAGKLSEFQHPNLVDLIGYCAEGDQRVLVYEYMPNGSLKDNLFGYTPSDWITRMKAASGAAQAIQYLHEKVNPPVLCRNLKCTNIL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_015002`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_015002

位置 Chr03:61303534-61306711 (+)

描述 Similar to PBL26: Probable serine/threonine-protein kinase PBL26

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g16500`	参与花粉管引导进入珠孔。	暂无已核实直接文献
`At3g07070`	可能参与植物防御信号传导。	暂无已核实直接文献
`At4g13190`	可能参与植物防御信号传导。	暂无已核实直接文献
`At5g02800`	参与正向调控油菜素甾醇（BR）信号转导和植物生长的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶。	暂无已核实直接文献
`At3g02810`	参与花粉管引导进入珠孔。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_015002 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程

GO:0006952 defense response 生物过程

GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程

GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程

GO:0010483 pollen tube reception 生物过程

GO:1900459 positive regulation of brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT3G02810

ath:AT3G07070

ath:AT4G13190

ath:AT5G02800

ath:AT5G16500

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.600

排名 1 · LXL04_015002 · OH-1004

细胞质0.289

排名 2 · LXL04_015002 · OH-1004

细胞核0.185

排名 3 · LXL04_015002 · OH-1004

内质网0.052

排名 4 · LXL04_015002 · OH-1004

高尔基体0.041

排名 5 · LXL04_015002 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069.32Pkinase132-395 aa

PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr135-396 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_015002	`PF00069.32`	Pkinase	132	395	7.2e-35	121.4
LXL04_015002	`PF07714.24`	PK_Tyr_Ser-Thr	135	396	2.6e-37	129.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q1PDW3`	拟南芥	Receptor-like kinase LIP1	57.980%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`Q9SFT7`	拟南芥	Probable serine/threonine-protein kinase PBL26	59.794%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`Q1PE89`	拟南芥	Probable serine/threonine-protein kinase PBL24	56.849%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`Q0WRY5`	拟南芥	Probable serine/threonine-protein kinase PBL7	54.232%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`Q9M8S2`	拟南芥	Receptor-like kinase LIP2	44.989%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据

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