LXL04_014094 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_014094

当前版本: OH-1004 染色体: Chr03 坐标: 42013510-42016072 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2251 bp · LXL04_014094|LXL04_014094|OH1004|cDNA

ATGTTACGTTCCAAATCCAGATCTGGTTATTTGGAATTTGGGCAAAAGAAGCAGCAATCGTTTCTCGTTAGAAGCATTTCCGGATCGAAGTTTTGCAGGGGAGATGCTCTTGCTTCACAAGTCGCTAAAGAAGCCGTTGTTCCCGTTGATCGCAAGTCCATTAGTTTATCAGAGAATCGGATTGTTAAGGCTGCCATGATGCAAAGGCAAGTAACCGATTTACAGGAGGAGTTGAAGAACACAAAGGCGAGATTAGATGA...

CDS

下载 CDS FASTA

2145 bp · LXL04_014094|LXL04_014094|OH1004|CDS

ATGTTACGTTCCAAATCCAGATCTGGTTATTTGGAATTTGGGCAAAAGAAGCAGCAATCGTTTCTCGTTAGAAGCATTTCCGGATCGAAGTTTTGCAGGGGAGATGCTCTTGCTTCACAAGTCGCTAAAGAAGCCGTTGTTCCCGTTGATCGCAAGTCCATTAGTTTATCAGAGAATCGGATTGTTAAGGCTGCCATGATGCAAAGGCAAGTAACCGATTTACAGGAGGAGTTGAAGAACACAAAGGCGAGATTAGATGA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

714 aa · LXL04_014094|LXL04_014094|OH1004|PROTEIN

MLRSKSRSGYLEFGQKKQQSFLVRSISGSKFCRGDALASQVAKEAVVPVDRKSISLSENRIVKAAMMQRQVTDLQEELKNTKARLDEAERERNRLYTELKGGLSSKKAEQVFSELNILKDSLLNSKKEIESRDRDMKILTSRLESAKVFEAKLSERDKKIRELEDQVAKAQQSESNMLESLMLQTQQLTEIKMDLEESKLEITSLYERLDNGGNNNTSRGNYNHNQNQNQNQNQYQASAETKALKDEIAMLKNEIKRATE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_014094`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_014094

位置 Chr03:42013510-42016072 (-)

描述 Similar to At1g65010: Putative WEB family protein At1g65010, chloroplastic

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g65010`	假定WEB家族蛋白At1g65010，叶绿体定位。	暂无已核实直接文献
`At3g02930`	WEB 家族蛋白 At3g02930，叶绿体。	暂无已核实直接文献
`At5g16730`	WEB家族蛋白At5g16730，叶绿体型。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_014094 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0007131 reciprocal meiotic recombination 生物过程

GO:0080175 phragmoplast microtubule organization 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分

GO:0005875 microtubule associated complex 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0009524 phragmoplast 细胞组分

GO:0009536 plastid 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G65010

ath:AT3G02930

ath:AT5G16730

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.489

排名 1 · LXL04_014094 · OH-1004

细胞质0.359

排名 2 · LXL04_014094 · OH-1004

细胞核0.269

排名 3 · LXL04_014094 · OH-1004

内质网0.044

排名 4 · LXL04_014094 · OH-1004

质体0.043

排名 5 · LXL04_014094 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

没有找到该查询的结果。

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`F4I8B9`	拟南芥	Putative WEB family protein At1g65010, chloroplastic	26.585%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`Q9M8T5`	拟南芥	WEB family protein At3g02930, chloroplastic	27.072%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`Q9LFE4`	拟南芥	WEB family protein At5g16730, chloroplastic	27.074%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据

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