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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_013931
当前版本: OH-1004 染色体: Chr03 坐标: 38318822-38324885 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3810 bp · LXL04_013931|LXL04_013931|OH1004|cDNA

ATGGCTTCCGATGCACCATCAATAATGGCTCAAAGTGTGAGAACAAGCAGATCTTCATTCAGCTCAAGCAATGGATATGAAACTCAATCTCACTATTCCGCCATTACAAACGGAGATGACTATGACAGCGATGGTTCAAATTTTGCACCACCTACGCCAATGACCCTCTCCAATTCCATTCCAGCCGAGCTTGCTGGTGCAATTCCCCTAATCGACAAATTCCAAGTAGAGGGTTTTCTAAGGTCCATGCAAAAACAAAT...

CDS

下载 CDS FASTA

3810 bp · LXL04_013931|LXL04_013931|OH1004|CDS

ATGGCTTCCGATGCACCATCAATAATGGCTCAAAGTGTGAGAACAAGCAGATCTTCATTCAGCTCAAGCAATGGATATGAAACTCAATCTCACTATTCCGCCATTACAAACGGAGATGACTATGACAGCGATGGTTCAAATTTTGCACCACCTACGCCAATGACCCTCTCCAATTCCATTCCAGCCGAGCTTGCTGGTGCAATTCCCCTAATCGACAAATTCCAAGTAGAGGGTTTTCTAAGGTCCATGCAAAAACAAAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1269 aa · LXL04_013931|LXL04_013931|OH1004|PROTEIN

MASDAPSIMAQSVRTSRSSFSSSNGYETQSHYSAITNGDDYDSDGSNFAPPTPMTLSNSIPAELAGAIPLIDKFQVEGFLRSMQKQINSAGKRGFFSKRSVGPQDREKFTFEDMLCFQKDPIPTSLLKINGDLVSRAVKLFQTILKYTGIDSSEKGNQIGIEDRIELVGKLFKQALKRSELRDELFAQISKQTRNCPDRQHLIRAWELMYLCASCMPPSKDIGGYLSEYIHDVAHNSNTDPDVQVYALNTLNALKCSVKA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_013931
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_013931
位置Chr03:38318822-38324885 (-)
描述Similar to KIN14E: Kinesin-like protein KIN-14E
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g65930 负端微管依赖性运动蛋白通过微管成束参与细胞分裂和毛状体形态发生的调节。
Bundling of microtubules by motor and tail domains of a kinesin-like calmodulin-binding protein from Arabidopsis: regulation by Ca(2+)/Calmodulin.2000 · DOI: 10.1006/bbrc.1999.1896
KIC, a novel Ca2+ binding protein with one EF-hand motif, interacts with a microtubule motor protein and regulates trichome morphogenesis.2004 · DOI: 10.1105/tpc.016600
Analysis of calcium/calmodulin regulation of a plant kinesin using co-sedimentation and ATPase assays.2007 · DOI: 10.1007/978-1-59745-490-2_2
PERK-KIPK-KCBP signalling negatively regulates root growth in Arabidopsis thaliana.2015 · DOI: 10.1093/jxb/eru390
A novel plant calmodulin-binding protein with a kinesin heavy chain motor domain.1996 · DOI: 10.1074/jbc.271.12.7052
In vitro motility of AtKCBP, a calmodulin-binding kinesin protein of Arabidopsis.1997 · DOI: 10.1073/pnas.94.1.322
Interaction of Arabidopsis kinesin-like calmodulin-binding protein with tubulin subunits: modulation by Ca(2+)-calmodulin.1997 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.1997.12051139.x
Characterization of microtubule binding domains in the Arabidopsis kinesin-like calmodulin binding protein.1998 · DOI: 10.1105/tpc.10.6.957
Ca2+/calmodulin regulation of the Arabidopsis kinesin-like calmodulin-binding protein.1998 · DOI: 10.1002/(sici)1097-0169(1998)40:4<408::aid-cm8>3.0.co;2-6
At5g27000 微管结合运动蛋白。 暂无已核实直接文献
At2g47500 类驱动蛋白KIN-14I。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0666900 与微管负端相关的运动蛋白，参与细胞分裂调控。 暂无已核实直接文献
Os03g0114000 类驱动蛋白 KIN-14E。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_013931 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0001578 microtubule bundle formation 生物过程
GO:0007017 microtubule-based process 生物过程
GO:0007018 microtubule-based movement 生物过程
GO:0010091 trichome branching 生物过程
GO:0043622 cortical microtubule organization 生物过程
GO:0048629 trichome patterning 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005856 cytoskeleton 细胞组分
GO:0005871 kinesin complex 细胞组分
GO:0005874 microtubule 细胞组分
GO:0009524 phragmoplast 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G47500
ath:AT5G27000
ath:AT5G65930
dosa:Os03g0114000
dosa:Os04g0666900
osa:4337322
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.651
排名 1 · LXL04_013931 · OH-1004
细胞膜0.296
排名 2 · LXL04_013931 · OH-1004
细胞核0.176
排名 3 · LXL04_013931 · OH-1004
高尔基体0.090
排名 4 · LXL04_013931 · OH-1004
溶酶体／液泡0.043
排名 5 · LXL04_013931 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00784.23MyTH4170-274 aa
PF21989.3RA_2279-381 aa
PF00373.24FERM_M386-501 aa
PF02174.24IRS512-588 aa
PF16796.12Microtub_bd874-1032 aa
PF00225.30Kinesin899-1214 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_013931PF00784.23MyTH41702746.4e-2897.9
LXL04_013931PF21989.3RA_22793811.3e-0629.1
LXL04_013931PF00373.24FERM_M3865011.6e-2177.5
LXL04_013931PF02174.24IRS5125883e-0731.1
LXL04_013931PF16796.12Microtub_bd87410321.7e-44152.2
LXL04_013931PF00225.30Kinesin89912145.3e-109364.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FHN8拟南芥Kinesin-like protein KIN-14E72.168%Swiss-Prot强数据库同源证据
O81635拟南芥Kinesin-like protein KIN-14G41.960%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
F4IL57拟南芥Kinesin-like protein KIN-14I39.651%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q7XPJ0水稻Kinesin-like protein KIN-14I71.832%Swiss-Prot强数据库同源证据
B9FAF3水稻Kinesin-like protein KIN-14E36.466%Swiss-Prot低置信数据库同源证据

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