LXL04_013811 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_013811

当前版本: OH-1004 染色体: Chr03 坐标: 36259807-36263793 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2868 bp · LXL04_013811|LXL04_013811|OH1004|cDNA

ATGGGGGAAAACGGTGGTAGTGGAGGAGGGGGGACGCGATCAGGGGACAGTGGTACCCGCCATGACGAGAGGATTTTTGTGTCTGTGCGGCTGCGACCTTTGAATGGAAGAGAAATTGTCACGAGCGATGTGTCTGATTGGGAATGTATCGGTCAAAACACAATCGCTTACAAGAATGGAAGCCTTGGTGTTCCGGAGAGATCCATGTACCCGTCGGCATATACATTCGACAGGGTTTTTGGCTACGATTGCTCCACACG...

CDS

下载 CDS FASTA

2868 bp · LXL04_013811|LXL04_013811|OH1004|CDS

ATGGGGGAAAACGGTGGTAGTGGAGGAGGGGGGACGCGATCAGGGGACAGTGGTACCCGCCATGACGAGAGGATTTTTGTGTCTGTGCGGCTGCGACCTTTGAATGGAAGAGAAATTGTCACGAGCGATGTGTCTGATTGGGAATGTATCGGTCAAAACACAATCGCTTACAAGAATGGAAGCCTTGGTGTTCCGGAGAGATCCATGTACCCGTCGGCATATACATTCGACAGGGTTTTTGGCTACGATTGCTCCACACG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

955 aa · LXL04_013811|LXL04_013811|OH1004|PROTEIN

MGENGGSGGGGTRSGDSGTRHDERIFVSVRLRPLNGREIVTSDVSDWECIGQNTIAYKNGSLGVPERSMYPSAYTFDRVFGYDCSTRQVYQDGAKDVVLSVVGGINASIFAYGQTSSGKTFTMTGITEYTLADIYDYVQKHPERDFHLKFSAMEIYNESVRDLLSSDGYPLRLLDDPERGTIVENLTDESIRDWDHMMELLSICEAQRQSGETSLNETSSRSHQIIRLTIESTPSNYLGRDSATTLVSTVNFVDLAGSER...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_013811`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_013811

位置 Chr03:36259807-36263793 (+)

描述 Similar to KIN7E: Kinesin-like protein KIN-7E

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At2g21300`	类 kinesin 蛋白 KIN-7E。	暂无已核实直接文献
`At5g66310`	类驱动蛋白KIN-7H。	暂无已核实直接文献
`At3g51150`	类驱动蛋白 KIN-7G。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os04g0538800`	体外结合ATP/ADP。	暂无已核实直接文献
`Os08g0547500`	类驱动蛋白KIN-7H。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_013811 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0007018 microtubule-based movement 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005874 microtubule 细胞组分

GO:0009506 plasmodesma 细胞组分

GO:0003777 microtubule motor activity 分子功能

GO:0005524 ATP binding 分子功能

GO:0008017 microtubule binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G21300

ath:AT3G51150

ath:AT5G66310

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.621

排名 1 · LXL04_013811 · OH-1004

细胞核0.282

排名 2 · LXL04_013811 · OH-1004

细胞膜0.174

排名 3 · LXL04_013811 · OH-1004

高尔基体0.060

排名 4 · LXL04_013811 · OH-1004

溶酶体／液泡0.050

排名 5 · LXL04_013811 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00225.30Kinesin30-349 aa

PF16796.12Microtub_bd65-164 aa

PF11995.14DUF3490775-935 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_013811	`PF00225.30`	Kinesin	30	349	6.8e-98	328.4
LXL04_013811	`PF16796.12`	Microtub_bd	65	164	7.9e-19	68.8
LXL04_013811	`PF11995.14`	DUF3490	775	935	3.9e-69	232.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`F4IGL2`	拟南芥	Kinesin-like protein KIN-7E	44.989%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`F4JZ68`	拟南芥	Kinesin-like protein KIN-7H	57.388%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`F4J394`	拟南芥	Kinesin-like protein KIN-7G	67.483%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`Q7X7H4`	水稻	Kinesin-like protein KIN-7F	57.904%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q6Z9D2`	水稻	Kinesin-like protein KIN-7H	70.343%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据

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