基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_012941
当前版本: OH-1004
染色体: Chr03
坐标: 21355402-21357192
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1275 bp · LXL04_012941|LXL04_012941|OH1004|cDNA
ATGAATCGGCTCACAAGTTCTGCTCGTCTCATGATCGTATCAGATCTTGACCATACCATGGTTGATCATCATGACCCCGAAAACCTCTCCATCCTAAGGTTTAATGCCTTATGGGAAGCTAAATACCGCCATGATTCATTACTGGTATTCTCAACTGGAAGGTCACCAACACTTTACAAACAATTGAGAAAAGAAAAGCCCATGTTGACCCCTGATATTACCATTATGTCCGTGGGGACCGAGATCACATACGGTAATGA...
CDS
下载 CDS FASTA1275 bp · LXL04_012941|LXL04_012941|OH1004|CDS
ATGAATCGGCTCACAAGTTCTGCTCGTCTCATGATCGTATCAGATCTTGACCATACCATGGTTGATCATCATGACCCCGAAAACCTCTCCATCCTAAGGTTTAATGCCTTATGGGAAGCTAAATACCGCCATGATTCATTACTGGTATTCTCAACTGGAAGGTCACCAACACTTTACAAACAATTGAGAAAAGAAAAGCCCATGTTGACCCCTGATATTACCATTATGTCCGTGGGGACCGAGATCACATACGGTAATGA...
424 aa · LXL04_012941|LXL04_012941|OH1004|PROTEIN
MNRLTSSARLMIVSDLDHTMVDHHDPENLSILRFNALWEAKYRHDSLLVFSTGRSPTLYKQLRKEKPMLTPDITIMSVGTEITYGNEMVPDEGWVDVLNHKWDKKIVTEETSKFPELTLQSETEQRPHKASFYVKKEKAQEVMKNLSEVLVKRGLDVKIIYSGGMDLDILPQGAGKGQALAYLHKKLIAEGKLPKNTLACGDSGNDAELFTIPDVHGVMVKNAQEELLHWYSENAKNNPKIIHADETCAAGIIQAIGHFK...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_012941 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_012941 | |||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr03:21355402-21357192 (-) | |||||||||||||||
| 描述 | Similar to SPP2: Sucrose-phosphatase 2 | |||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| |||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0005986 sucrose biosynthetic process 生物过程 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005737 cytoplasm 细胞组分 GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分 GO:0005829 cytosol 细胞组分 GO:0009506 plasmodesma 细胞组分 GO:0000287 magnesium ion binding 分子功能 GO:0050307 sucrose-phosphate phosphatase activity 分子功能 | |||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT2G35840 dosa:Os01g0376700 dosa:Os02g0143100 nta:107767908 nta:107819363 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞质0.602
细胞核0.294
线粒体0.137
细胞膜0.101
内质网0.092
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF05116.20S6PP9-260 aaPF08282.19Hydrolase_379-229 aaPF08472.17S6PP_C283-412 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_012941 | PF05116.20 | S6PP | 9 | 260 | 2.7e-100 | 335.8 |
| LXL04_012941 | PF08282.19 | Hydrolase_3 | 79 | 229 | 1.6e-14 | 55.0 |
| LXL04_012941 | PF08472.17 | S6PP_C | 283 | 412 | 5.3e-50 | 169.4 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。