基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_012224
当前版本: OH-1004
染色体: Chr03
坐标: 8603118-8605571
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1413 bp · LXL04_012224|LXL04_012224|OH1004|cDNA
aTGCATCCCCTTCGCCGGAAAGTCTCCCTCTTCTCCTCCTACACCGCCGCCATGAAACAACGCAAAAACAACAACCTGTCCGTCTTCGTCGTCGTCTTCTCTATTTTCCTATTCGGGTTCTTCATGTACAATGAAGACGTCAAATCCATAGCCGAATTTCCATTCTCCAGGCCTAAATTCGCAACCCACGAAACTTCTATTCAGAAATCGAACGTTGACGGGGTGGTCGAGATCAGTTCCAGAACGACTTTAGTGGTGGA...
CDS
下载 CDS FASTA1413 bp · LXL04_012224|LXL04_012224|OH1004|CDS
ATGCATCCCCTTCGCCGGAAAGTCTCCCTCTTCTCCTCCTACACCGCCGCCATGAAACAACGCAAAAACAACAACCTGTCCGTCTTCGTCGTCGTCTTCTCTATTTTCCTATTCGGGTTCTTCATGTACAATGAAGACGTCAAATCCATAGCCGAATTTCCATTCTCCAGGCCTAAATTCGCAACCCACGAAACTTCTATTCAGAAATCGAACGTTGACGGGGTGGTCGAGATCAGTTCCAGAACGACTTTAGTGGTGGA...
470 aa · LXL04_012224|LXL04_012224|OH1004|PROTEIN
MHPLRRKVSLFSSYTAAMKQRKNNNLSVFVVVFSIFLFGFFMYNEDVKSIAEFPFSRPKFATHETSIQKSNVDGVVEISSRTTLVVESKTEDNQVIELPAPVAVAEEVEPEDDEEIEIPPEECDLYDGNWVFDDSTHPLYKEDECEFLTAQVTCMRNGRKDSMYQNWRWQPKNCNLPKFRAKLLLEKLRNKRLMFVGDSLNRNQWESMVCLAQSIIPPGRKSLNKTGSLSIFRIEDYNATVEFYWAPFLVESNSDDPNMH...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_012224 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_012224 | ||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr03:8603118-8605571 (-) | ||||||||||||
| 描述 | Similar to ESK1: Protein ESKIMO 1 | ||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥水稻
| ||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0009409 response to cold 生物过程 GO:0045492 xylan biosynthetic process 生物过程 GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程 GO:0050826 response to freezing 生物过程 GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分 GO:0016020 membrane 细胞组分 GO:0016413 O-acetyltransferase activity 分子功能 GO:1990538 xylan O-acetyltransferase activity 分子功能 | ||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT2G40150 ath:AT3G55990 dosa:Os03g0291800 dosa:Os05g0354400 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
高尔基体0.615
细胞膜0.096
内质网0.072
细胞外0.049
细胞质0.032
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF14416.12PMR5N121-175 aaPF13839.13PC-Esterase176-464 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_012224 | PF14416.12 | PMR5N | 121 | 175 | 1.3e-22 | 80.6 |
| LXL04_012224 | PF13839.13 | PC-Esterase | 176 | 464 | 2e-94 | 317.4 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9LY46 | 拟南芥 | Xylan O-acetyltransferase 1 | 72.177% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q94K00 | 拟南芥 | Protein trichome birefringence-like 28 | 63.445% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q10MX2 | 水稻 | Xylan O-acetyltransferase 6 | 67.422% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
A0A0P0WL81 | 水稻 | Xylan O-acetyltransferase 5 | 66.857% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q8S237 | 水稻 | Xylan O-acetyltransferase 1 | 48.193% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |