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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_011873
当前版本: OH-1004 染色体: Chr03 坐标: 2055073-2058975 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3903 bp · LXL04_011873|LXL04_011873|OH1004|cDNA

ATGGTGTTCAAGTTTCTTCCCCTCTCATGCATATTACTtggcttcttcttcctcactaATGCCGCCATTATCGATCAAAACCCAGAAACAGAGAGCTTGCTTTTTTTCAAGAGCTCGCTTTTGAACCCTAATACACTCTCCACCTGGAACCTCACTGCCCCACATTGTCAATGGGAAGGTGTTACTTGCCAAAACGAACGAGTTACTTCACTCGTTCTTTCAACTCACTCACTCAAAGGCCGACTCCATATTTCTCTTTT...

CDS

下载 CDS FASTA

3903 bp · LXL04_011873|LXL04_011873|OH1004|CDS

ATGGTGTTCAAGTTTCTTCCCCTCTCATGCATATTACTTGGCTTCTTCTTCCTCACTAATGCCGCCATTATCGATCAAAACCCAGAAACAGAGAGCTTGCTTTTTTTCAAGAGCTCGCTTTTGAACCCTAATACACTCTCCACCTGGAACCTCACTGCCCCACATTGTCAATGGGAAGGTGTTACTTGCCAAAACGAACGAGTTACTTCACTCGTTCTTTCAACTCACTCACTCAAAGGCCGACTCCATATTTCTCTTTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1300 aa · LXL04_011873|LXL04_011873|OH1004|PROTEIN

MVFKFLPLSCILLGFFFLTNAAIIDQNPETESLLFFKSSLLNPNTLSTWNLTAPHCQWEGVTCQNERVTSLVLSTHSLKGRLHISLFSLSNLVVLDLSSNLFSGELPREISQLLRLQVLKLGDNQFSGGLPSELGDLIQLQTLELGPNFFSGVIPADIGRLSNLESLDLSSNSFTGIIPPEIKNLKKLRSLGLGNNFLSGSLSPSLLTNLHNLIFLDVANNTLSGEIPSEIGTLSNLTDLYLGINRFSGLLPPEIGNLEN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_011873
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_011873
位置Chr03:2055073-2058975 (+)
描述Similar to EMS1: Leucine-rich repeat receptor protein kinase EMS1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g07280 具有丝氨酸／苏氨酸蛋白激酶活性的受体，决定雄性孢原细胞起始细胞的正确数量，并进一步决定绒毡层和中间层细胞的特性。 暂无已核实直接文献
At4g20140 与GSO2共同参与胚胎和子叶表皮表面发育所需的受体样丝氨酸／苏氨酸激酶。
GASSHO1 and GASSHO2 encoding a putative leucine-rich repeat transmembrane-type receptor kinase are essential for the normal development of the epidermal surface in Arabidopsis embryos.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03395.x
The receptor-like kinases GSO1 and GSO2 together regulate root growth in Arabidopsis through control of cell division and cell fate specification.2014 · DOI: 10.1002/dvdy.24066
A peptide hormone required for Casparian strip diffusion barrier formation in Arabidopsis roots.2017 · DOI: 10.1126/science.aai9057
At2g01950 受体具有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性，可能将细胞外空间和时间信号转导为前血管和原形成层细胞的下游细胞分化反应。
VH1/BRL2 receptor-like kinase interacts with vascular-specific adaptor proteins VIT and VIK to influence leaf venation.2009 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2008.03742.x

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0917500 类受体激酶，在限制进入雄性和雌性孢子发生的细胞数量方面发挥重要作用。
The MSP1 gene is necessary to restrict the number of cells entering into male and female sporogenesis and to initiate anther wall formation in rice.2003 · DOI: 10.1105/tpc.012401
Os02g0194400 类受体激酶，可能在雄性和雌性孢子发生中发挥作用。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_011873 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009554 megasporogenesis 生物过程
GO:0009556 microsporogenesis 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0010234 anther wall tapetum cell fate specification 生物过程
GO:0042659 regulation of cell fate specification 生物过程
GO:0045184 establishment of protein localization 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0048658 anther wall tapetum development 生物过程
GO:0051302 regulation of cell division 生物过程
GO:0055075 potassium ion homeostasis 生物过程
GO:0090708 specification of plant organ axis polarity 生物过程
GO:0160073 Casparian strip assembly 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G20140
ath:AT5G07280
dosa:Os01g0917500
dosa:Os02g0194400
osa:4324355
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.841
排名 1 · LXL04_011873 · OH-1004
内质网0.093
排名 2 · LXL04_011873 · OH-1004
细胞质0.066
排名 3 · LXL04_011873 · OH-1004
细胞核0.048
排名 4 · LXL04_011873 · OH-1004
溶酶体／液泡0.032
排名 5 · LXL04_011873 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263.18LRRNT_227-63 aa
PF23598.2LRR_1486-214 aa
PF13855.13LRR_8139-196 aa
PF00560.40LRR_1163-185 aa
PF12799.14LRR_4163-199 aa
PF23598.2LRR_14180-374 aa
PF13855.13LRR_8276-317 aa
PF13855.13LRR_8380-438 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_011873PF08263.18LRRNT_227637.7e-0936.4
LXL04_011873PF23598.2LRR_14862142e-44152.5
LXL04_011873PF13855.13LRR_81391969.9e-63208.5
LXL04_011873PF00560.40LRR_11631851.3e-75233.5
LXL04_011873PF12799.14LRR_41631991.3e-46156.2
LXL04_011873PF23598.2LRR_141803742e-44152.5
LXL04_011873PF13855.13LRR_82763179.9e-63208.5
LXL04_011873PF13855.13LRR_83804389.9e-63208.5
LXL04_011873PF13855.13LRR_84284859.9e-63208.5
LXL04_011873PF12799.14LRR_45235561.3e-46156.2
LXL04_011873PF13855.13LRR_85466059.9e-63208.5
LXL04_011873PF12799.14LRR_45706101.3e-46156.2
LXL04_011873PF13855.13LRR_86597149.9e-63208.5
LXL04_011873PF12799.14LRR_46596901.3e-46156.2
LXL04_011873PF13855.13LRR_86787389.9e-63208.5
LXL04_011873PF12799.14LRR_47037411.3e-46156.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LYN8拟南芥Leucine-rich repeat receptor protein kinase EMS155.937%Swiss-Prot强数据库同源证据
C0LGQ5拟南芥LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase GSO136.088%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9ZPS9拟南芥Serine/threonine-protein kinase BRI1-like 237.830%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q8RZV7水稻Leucine-rich repeat receptor protein kinase MSP142.072%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q7F8Q9水稻Leucine-rich repeat receptor protein kinase MSL139.846%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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