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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_008831
当前版本: OH-1004 染色体: Chr02 坐标: 109881891-109885292 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3402 bp · LXL04_008831|LXL04_008831|OH1004|cDNA

ATGCCAACGGTCACTTTTCTTATACTTGCATTTCTCGCCACCGTGCTATTCTGCGCCACTCTCTCCACCACCGCTACAACGACGGAGATAGATGCTCTAACATCCTTCAAAGAAAATGTACGCGATCCACTCGGCGCGTTGGATGCCTGGAATACTTCTACGCCGGCTGCCCCGTGTGACTGGCGTGGGATTTCCTGTACAGACGGCAGAGTTCGTGAAATTCGTTTAGCTCGGCTTGGTTTATCTGGCCGGCTGAGTAG...

CDS

下载 CDS FASTA

3402 bp · LXL04_008831|LXL04_008831|OH1004|CDS

ATGCCAACGGTCACTTTTCTTATACTTGCATTTCTCGCCACCGTGCTATTCTGCGCCACTCTCTCCACCACCGCTACAACGACGGAGATAGATGCTCTAACATCCTTCAAAGAAAATGTACGCGATCCACTCGGCGCGTTGGATGCCTGGAATACTTCTACGCCGGCTGCCCCGTGTGACTGGCGTGGGATTTCCTGTACAGACGGCAGAGTTCGTGAAATTCGTTTAGCTCGGCTTGGTTTATCTGGCCGGCTGAGTAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1133 aa · LXL04_008831|LXL04_008831|OH1004|PROTEIN

MPTVTFLILAFLATVLFCATLSTTATTTEIDALTSFKENVRDPLGALDAWNTSTPAAPCDWRGISCTDGRVREIRLARLGLSGRLSSRISELSQLRTLSLHTNNFNGSIPSALSQCSLLRVVYLQYNYFSGVLPPAFGNLTNLLVLNVAHNFLSGELPANLPPKVRYLDVSSNAVSGNIPANLSVSSEIQLINLSFNALSGQVPPVIGDFQNLQYLFLDSNNLYGTLPSAIANCSSLIHLSADNNQLQGLIPASIGNLLN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_008831
TK1151 IDTkA03G325090
OH-1004 IDLXL04_008831
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)97.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_008831
位置Chr02:109881891-109885292 (-)
描述Similar to At4g36180: Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g36180
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g36180 可能的 LRR 类似受体丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At4g36180。 暂无已核实直接文献
At5g46330 构成模式识别受体（PPR），决定对鞭毛蛋白（flg22）的特异性识别，flg22是引发对病原相关分子模式（PAMPs）防御反应的有效诱导因子。 暂无已核实直接文献
At1g73080 充当 PEP 防御肽的受体。
The cell surface leucine-rich repeat receptor for AtPep1, an endogenous peptide elicitor in Arabidopsis, is functional in transgenic tobacco cells.2006 · DOI: 10.1073/pnas.0603729103
BIK1 interacts with PEPRs to mediate ethylene-induced immunity.2013 · DOI: 10.1073/pnas.1215543110

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0576900 在器官发育的早期阶段通过调节细胞分裂速率发挥功能。
XIAO is involved in the control of organ size by contributing to the regulation of signaling and homeostasis of brassinosteroids and cell cycling in rice.2012 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2011.04877.x
Os04g0618700 构成模式识别受体（PPR），决定对鞭毛蛋白（flg22）的特异性识别，flg22是引发对病原相关分子模式（PAMPs）防御反应的有效诱导因子。
Analysis of flagellin perception mediated by flg22 receptor OsFLS2 in rice.2008 · DOI: 10.1094/mpmi-21-12-1635
Rice OsFLS2-Mediated Perception of Bacterial Flagellins Is Evaded by Xanthomonas oryzae pvs. oryzae and oryzicola.2015 · DOI: 10.1016/j.molp.2015.01.012
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_008831 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006898 receptor-mediated endocytosis 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0006955 immune response 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009753 response to jasmonic acid 生物过程
GO:0016045 detection of bacterium 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0045087 innate immune response 生物过程
GO:0052544 defense response by callose deposition in cell wall 生物过程
GO:0090696 post-embryonic plant organ development 生物过程
GO:0140426 pathogen-associated molecular pattern receptor signaling pathway 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G73080
ath:AT4G36180
ath:AT5G46330
dosa:Os04g0576900
dosa:Os04g0618700
osa:4336741
osa:4337016
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.872
排名 1 · LXL04_008831 · OH-1004
内质网0.080
排名 2 · LXL04_008831 · OH-1004
细胞质0.064
排名 3 · LXL04_008831 · OH-1004
细胞核0.048
排名 4 · LXL04_008831 · OH-1004
溶酶体／液泡0.023
排名 5 · LXL04_008831 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263.18LRRNT_228-67 aa
PF13855.13LRR_894-151 aa
PF13855.13LRR_8119-173 aa
PF23598.2LRR_14196-268 aa
PF13855.13LRR_8212-271 aa
PF13855.13LRR_8312-371 aa
PF23598.2LRR_14313-415 aa
PF23598.2LRR_14381-466 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_008831PF08263.18LRRNT_228671.3e-0938.8
LXL04_008831PF13855.13LRR_8941515.9e-60199.6
LXL04_008831PF13855.13LRR_81191735.9e-60199.6
LXL04_008831PF23598.2LRR_141962686.6e-40137.7
LXL04_008831PF13855.13LRR_82122715.9e-60199.6
LXL04_008831PF13855.13LRR_83123715.9e-60199.6
LXL04_008831PF23598.2LRR_143134156.6e-40137.7
LXL04_008831PF23598.2LRR_143814666.6e-40137.7
LXL04_008831PF13855.13LRR_83844435.9e-60199.6
LXL04_008831PF12799.14LRR_44324667.1e-45150.7
LXL04_008831PF23598.2LRR_144876056.6e-40137.7
LXL04_008831PF13855.13LRR_85035625.9e-60199.6
LXL04_008831PF13855.13LRR_85766355.9e-60199.6
LXL04_008831PF12799.14LRR_45766127.1e-45150.7
LXL04_008831PF23598.2LRR_145777176.6e-40137.7
LXL04_008831PF13855.13LRR_86487075.9e-60199.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
C0LGS2拟南芥Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g3618059.507%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9FL28拟南芥LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase FLS233.864%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9SSL9拟南芥Leucine-rich repeat receptor-like protein kinase PEPR134.386%Swiss-Prot中等数据库同源证据
G9LZD7水稻Probable inactive leucine-rich repeat receptor kinase XIAO54.352%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q0JA29水稻LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase FLS232.912%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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