LXL04_008627 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_008627

当前版本: OH-1004 染色体: Chr02 坐标: 104574237-104580991 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2847 bp · LXL04_008627|LXL04_008627|OH1004|cDNA

ATGTGGTTGGCGGTGGTGTTAGGAATAGGGCCGCTGCTAGGATGGCTATTGTGGTGGTGGAACGATATCTGGTATGGGCTAGTCACCGGAAGTCTCCAGTCATCCAACAGTGGCACCAAGCTACCTCCCGGCCACATGGGTCTTCCAATCATTGGTGAAATGTTCATGTTTCTATGGTACTTCAAGTTCCTAAAGTGTCCCGACGATTACATAAATTTCAAGCGTCGCAAGTATGGTGACGGGATAGGCATTTATAAGAC...

CDS

下载 CDS FASTA

2847 bp · LXL04_008627|LXL04_008627|OH1004|CDS

ATGTGGTTGGCGGTGGTGTTAGGAATAGGGCCGCTGCTAGGATGGCTATTGTGGTGGTGGAACGATATCTGGTATGGGCTAGTCACCGGAAGTCTCCAGTCATCCAACAGTGGCACCAAGCTACCTCCCGGCCACATGGGTCTTCCAATCATTGGTGAAATGTTCATGTTTCTATGGTACTTCAAGTTCCTAAAGTGTCCCGACGATTACATAAATTTCAAGCGTCGCAAGTATGGTGACGGGATAGGCATTTATAAGAC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

948 aa · LXL04_008627|LXL04_008627|OH1004|PROTEIN

MWLAVVLGIGPLLGWLLWWWNDIWYGLVTGSLQSSNSGTKLPPGHMGLPIIGEMFMFLWYFKFLKCPDDYINFKRRKYGDGIGIYKTHLFGKPSVIVFSPAATKYVFRAEEQFVLEWPNVEIVGKSSIVAVHGKTHTRLRSFVSKSINQPEALRRIAHTVQPRMIASLQSWAKRGIINSYKEVKKVTFENIGMYFASFEPGPTLDTLAESFMGMVGGIRSYPLNIPGFAYHRGIQGRKKTMGIFRKELEKRKKDMEEGSQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_008627`
TK1151 ID	TkA03G351940
OH-1004 ID	LXL04_008627
关系 / 置信度	序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 98.340 / OH-1004 50.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_008627

位置 Chr02:104574237-104580991 (-)

描述 Similar to KAO1: Ent-kaurenoic acid oxidase 1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g05160`	催化莨菪酸(ent-kaurenoic acid)的三步连续氧化反应生成赤霉素12（GA12），这是赤霉素（GAs）生物合成的关键步骤。	暂无已核实直接文献
`At2g32440`	催化莨菪酸(ent-kaurenoic acid)的三步连续氧化反应生成赤霉素12（GA12），这是赤霉素（GAs）生物合成的关键步骤。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os06g0110000`	参与赤霉素（GA）生物合成。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_008627 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009686 gibberellin biosynthetic process 生物过程

GO:0010268 brassinosteroid homeostasis 生物过程

GO:0016125 sterol metabolic process 生物过程

GO:0016132 brassinosteroid biosynthetic process 生物过程

GO:0048868 pollen tube development 生物过程

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分

GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分

GO:0016020 membrane 细胞组分

GO:0005506 iron ion binding 分子功能

GO:0020037 heme binding 分子功能

GO:0051777 ent-kaurenoic acid monooxygenase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ag:BAG68929

ath:AT1G05160

ath:AT2G32440

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.877

排名 1 · LXL04_008627 · OH-1004

细胞质0.080

排名 2 · LXL04_008627 · OH-1004

细胞膜0.050

排名 3 · LXL04_008627 · OH-1004

溶酶体／液泡0.043

排名 4 · LXL04_008627 · OH-1004

线粒体0.039

排名 5 · LXL04_008627 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00067.28p45042-458 aa

PF00067.28p450508-926 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_008627	`PF00067.28`	p450	42	458	2.1e-107	360.5
LXL04_008627	`PF00067.28`	p450	508	926	2.1e-107	360.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`O23051`	拟南芥	Ent-kaurenoic acid oxidase 1	37.255%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`Q9C5Y2`	拟南芥	Ent-kaurenoic acid oxidase 2	35.955%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`Q5VRM7`	水稻	Ent-kaurenoic acid oxidase	35.841%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据

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