基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_007935
当前版本: OH-1004
染色体: Chr02
坐标: 75973818-75977633
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA3084 bp · LXL04_007935|LXL04_007935|OH1004|cDNA
ATGGAGAGCTATTTGAATGATAATTTCGAGGTCAAGCCGAAGAACTCATCGGAGGAAGCGCTGCAGAGATGGAGGAAGTTGTGTTGGGTGGTGAAGAATCGGAAACGACGTTTCCGTTTCACTGCTAATCTCTCCAAGCGTTTCGAAGCTCGTGCTATTCAACGATCCAATCTGGTCAATCCTCTTTCTCTTTTGCACTGTTTCATTTTCCGTGACGAGAGTCTAAGAACCTTGATGCTGGTTTCACATGCAGCCATTCA...
CDS
下载 CDS FASTA3084 bp · LXL04_007935|LXL04_007935|OH1004|CDS
ATGGAGAGCTATTTGAATGATAATTTCGAGGTCAAGCCGAAGAACTCATCGGAGGAAGCGCTGCAGAGATGGAGGAAGTTGTGTTGGGTGGTGAAGAATCGGAAACGACGTTTCCGTTTCACTGCTAATCTCTCCAAGCGTTTCGAAGCTCGTGCTATTCAACGATCCAATCTGGTCAATCCTCTTTCTCTTTTGCACTGTTTCATTTTCCGTGACGAGAGTCTAAGAACCTTGATGCTGGTTTCACATGCAGCCATTCA...
1027 aa · LXL04_007935|LXL04_007935|OH1004|PROTEIN
MESYLNDNFEVKPKNSSEEALQRWRKLCWVVKNRKRRFRFTANLSKRFEARAIQRSNLVNPLSLLHCFIFRDESLRTLMLVSHAAIQFLNGITYSVPDEVKAAGFQIGPDELGSIVEGRSLEKLKGHDGVEGIVKKISTSTSNGISTSEDLLTRRKDIYGINQFTESPSKGFLVYIWEALQDTTLMILGLCASVSLIVGIIMEGWPKGAHDGLGIVASIMLVVFVTATSDYRQSLQFKDLDKEKKKITIQVTRNDCRQKI...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_007935 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_007935 | |||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr02:75973818-75977633 (-) | |||||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to ACA1: Calcium-transporting ATPase 1 | |||||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| |||||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0009555 pollen development 生物过程 GO:0070588 calcium ion transmembrane transport 生物过程 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分 GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 GO:0009507 chloroplast 细胞组分 GO:0009706 chloroplast inner membrane 细胞组分 GO:0016020 membrane 细胞组分 GO:0005262 calcium channel activity 分子功能 GO:0005388 P-type calcium transporter activity 分子功能 GO:0005516 calmodulin binding 分子功能 | |||||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G27770 ath:AT2G22950 ath:AT4G37640 dosa:Os03g0616400 dosa:Os12g0586600 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞膜0.462
内质网0.204
溶酶体／液泡0.170
高尔基体0.110
细胞质0.109
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF12515.14CaATP_NAI5-49 aaPF00690.32Cation_ATPase_N128-195 aaPF00122.26E1-E2_ATPase247-344 aaPF13246.13Cation_ATPase521-669 aaPF00702.33Hydrolase638-776 aaPF00689.27Cation_ATPase_C847-1022 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_007935 | PF12515.14 | CaATP_NAI | 5 | 49 | 1.7e-21 | 76.1 |
| LXL04_007935 | PF00690.32 | Cation_ATPase_N | 128 | 195 | 8.2e-08 | 32.5 |
| LXL04_007935 | PF00122.26 | E1-E2_ATPase | 247 | 344 | 2.6e-21 | 76.0 |
| LXL04_007935 | PF13246.13 | Cation_ATPase | 521 | 669 | 1e-34 | 120.7 |
| LXL04_007935 | PF00702.33 | Hydrolase | 638 | 776 | 7.7e-15 | 56.5 |
| LXL04_007935 | PF00689.27 | Cation_ATPase_C | 847 | 1022 | 7e-41 | 140.6 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q37145 | 拟南芥 | Calcium-transporting ATPase 1 | 75.942% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
O81108 | 拟南芥 | Calcium-transporting ATPase 2, plasma membrane-type | 73.761% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
O64806 | 拟南芥 | Putative calcium-transporting ATPase 7, plasma membrane-type | 73.883% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q2QMX9 | 水稻 | Calcium-transporting ATPase 10, plasma membrane-type | 74.081% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q6ATV4 | 水稻 | Calcium-transporting ATPase 3, plasma membrane-type | 68.991% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |