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基因概览

LXL04_007816

当前版本: OH-1004 染色体: Chr02 坐标: 63200689-63204119 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

669 bp · LXL04_007816|LXL04_007816|OH1004|cDNA

ATGCGTTTCTCATCCCACAATTTTCTTTCCTCTGCCATAGGAATCGGTACCGATAGGTACCGTCCGTTTGAAATTCAAATCTTCGGGCGAGAATGCTGGAAAAAGCTGGAGGAGCAGGCGGATCTGCAACTCCTGGATGTTAAACGGAGCCACCACCATCATCGTGCCCTGTCCACTTCCGAATCAATCCTAGAGTACCACCCCCAAATGCTGCAAGAATACCTCCATGGCGAGGAACACATCAGCTTCGTGTATCCAAG...

CDS

下载 CDS FASTA

669 bp · LXL04_007816|LXL04_007816|OH1004|CDS

ATGCGTTTCTCATCCCACAATTTTCTTTCCTCTGCCATAGGAATCGGTACCGATAGGTACCGTCCGTTTGAAATTCAAATCTTCGGGCGAGAATGCTGGAAAAAGCTGGAGGAGCAGGCGGATCTGCAACTCCTGGATGTTAAACGGAGCCACCACCATCATCGTGCCCTGTCCACTTCCGAATCAATCCTAGAGTACCACCCCCAAATGCTGCAAGAATACCTCCATGGCGAGGAACACATCAGCTTCGTGTATCCAAG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

222 aa · LXL04_007816|LXL04_007816|OH1004|PROTEIN

MRFSSHNFLSSAIGIGTDRYRPFEIQIFGRECWKKLEEQADLQLLDVKRSHHHHRALSTSESILEYHPQMLQEYLHGEEHISFVYPSGIDRFKQQFVDLEEQEGKGGRNSPLRRQYTSLPRADLNEFERRTNASIATTLRSPPRSSERTKNVNKKDSKNIPNPKTMSRSSSINSRTQQQGLQDECIHFLYETKTIKRNHFVVFLETKPLTENMWSMRHYAGT

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_007816`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_007816

位置 Chr02:63200689-63204119 (-)

描述 Similar to MPK13: Mitogen-activated protein kinase 13

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g18040`	丝裂原活化蛋白激酶9。	暂无已核实直接文献
`At1g73670`	丝裂原活化蛋白激酶 15。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os02g0135200`	丝裂原活化蛋白激酶13。	暂无已核实直接文献
`UniProt: A2X0M1`	丝裂原活化蛋白激酶13。	暂无已核实直接文献
`Os06g0708000`	可能参与防御信号通路。	BWMK1, a rice mitogen-activated protein kinase, locates in the nucleus and mediates pathogenesis-related gene expression by activation of a transcription factor.2003 · DOI: 10.1104/pp.103.023176

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_007816 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006952 defense response 生物过程

GO:0007165 signal transduction 生物过程

GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程

GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能

GO:0004707 MAP kinase activity 分子功能

GO:0005524 ATP binding 分子功能

GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G73670

ath:AT3G18040

dosa:Os02g0135200

dosa:Os06g0708000

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.442

排名 1 · LXL04_007816 · OH-1004

细胞核0.356

排名 2 · LXL04_007816 · OH-1004

细胞膜0.146

排名 3 · LXL04_007816 · OH-1004

线粒体0.129

排名 4 · LXL04_007816 · OH-1004

内质网0.056

排名 5 · LXL04_007816 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

没有找到该查询的结果。

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9LV37`	拟南芥	Mitogen-activated protein kinase 9	46.341%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q9C9U4`	拟南芥	Mitogen-activated protein kinase 15	40.667%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q0E459`	水稻	Mitogen-activated protein kinase 13	44.444%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`A2X0M1`	水稻	Mitogen-activated protein kinase 13	44.444%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q5Z9J0`	水稻	Mitogen-activated protein kinase 12	52.577%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据

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