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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_007622
当前版本: OH-1004 染色体: Chr02 坐标: 54362832-54365668 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1488 bp · LXL04_007622|LXL04_007622|OH1004|cDNA

ATGGAGTTCAAAGATTCGATTTCTGGCGCTTTTGCATCGTGCATTGAAAGGCAAAAGACTGCCAAACCTTCTGTAATCGTGATAGGAAGTGGGATTTCGGGAATAGCTGCTGCTCATGTACTCAATAATGCTGATTTTGAGGTGGTACCATTACTACACAGGTTGTGTTATTGGAATCCCGGGATAGAATTGGTGGTCGCATTCACACTGATTACTCATTTGGTTGTCCGGTCGATATGGGAGCATCATGGCAAGTTACA...

CDS

下载 CDS FASTA

1488 bp · LXL04_007622|LXL04_007622|OH1004|CDS

ATGGAGTTCAAAGATTCGATTTCTGGCGCTTTTGCATCGTGCATTGAAAGGCAAAAGACTGCCAAACCTTCTGTAATCGTGATAGGAAGTGGGATTTCGGGAATAGCTGCTGCTCATGTACTCAATAATGCTGATTTTGAGGTGGTACCATTACTACACAGGTTGTGTTATTGGAATCCCGGGATAGAATTGGTGGTCGCATTCACACTGATTACTCATTTGGTTGTCCGGTCGATATGGGAGCATCATGGCAAGTTACA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

495 aa · LXL04_007622|LXL04_007622|OH1004|PROTEIN

MEFKDSISGAFASCIERQKTAKPSVIVIGSGISGIAAAHVLNNADFEVVPLLHRLCYWNPGIELVVAFTLITHLVVRSIWEHHGKLHGVCNENPLAPLIRRLGLALYRTSGDNSVLYDHDLESYMLFDKEGHQVPQQMVIEVGEAFKKILKETEKVRDENQDDLSVLQAISVVLGRHPELRQEGLAYEVLQWYICRMEAWFAADLDMISLKNWDEENVLTGGHGLMVEGYYPVLKALSKDIDIRLNHRVTKIWNGPTDVM...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_007622
TK1151 IDTkA03G197620
OH-1004 IDLXL04_007622
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)91.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 96.401 / OH-1004 77.374
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_007622
位置Chr02:54362832-54365668 (+)
描述Similar to PAO4: Probable polyamine oxidase 4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g65840 涉及多胺逆转作用的黄素酶。
A putative peroxisomal polyamine oxidase, AtPAO4, is involved in polyamine catabolism in Arabidopsis thaliana.2008 · DOI: 10.1093/pcp/pcn114
Characterization of five polyamine oxidase isoforms in Arabidopsis thaliana.2010 · DOI: 10.1007/s00299-010-0881-1
Functional diversity inside the Arabidopsis polyamine oxidase gene family.2011 · DOI: 10.1093/jxb/erq341
Global Metabolic Profiling of Arabidopsis Polyamine Oxidase 4 (AtPAO4) Loss-of-Function Mutants Exhibiting Delayed Dark-Induced Senescence.2016 · DOI: 10.3389/fpls.2016.00173
At3g59050 涉及多胺逆转作用的黄素酶。
Bridging the gap between plant and mammalian polyamine catabolism: a novel peroxisomal polyamine oxidase responsible for a full back-conversion pathway in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1104/pp.108.123802
Characterization of five polyamine oxidase isoforms in Arabidopsis thaliana.2010 · DOI: 10.1007/s00299-010-0881-1
Spermidine oxidase-derived H₂O₂ regulates pollen plasma membrane hyperpolarization-activated Ca(2+) -permeable channels and pollen tube growth.2010 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2010.04301.x
Functional diversity inside the Arabidopsis polyamine oxidase gene family.2011 · DOI: 10.1093/jxb/erq341

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0671300 涉及多胺逆转作用的黄素酶。
Constitutively and highly expressed Oryza sativa polyamine oxidases localize in peroxisomes and catalyze polyamine back conversion.2012 · DOI: 10.1007/s00726-011-1002-3
Involvement of Polyamine Oxidase-Produced Hydrogen Peroxide during Coleorhiza-Limited Germination of Rice Seeds.2016 · DOI: 10.3389/fpls.2016.01219
Os04g0671200 涉及多胺逆转作用的黄素酶。
Constitutively and highly expressed Oryza sativa polyamine oxidases localize in peroxisomes and catalyze polyamine back conversion.2012 · DOI: 10.1007/s00726-011-1002-3
Os04g0623300 涉及多胺逆转作用的黄素酶。
Constitutively and highly expressed Oryza sativa polyamine oxidases localize in peroxisomes and catalyze polyamine back conversion.2012 · DOI: 10.1007/s00726-011-1002-3
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_007622 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006598 polyamine catabolic process 生物过程
GO:0046203 spermidine catabolic process 生物过程
GO:0046208 spermine catabolic process 生物过程
GO:1903602 thermospermine catabolic process 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005777 peroxisome 细胞组分
GO:0046592 polyamine oxidase activity 分子功能
GO:0050660 flavin adenine dinucleotide binding 分子功能
GO:0052900 spermine oxidase (propane-1,3-diamine-forming) activity 分子功能
GO:0052901 spermine oxidase activity 分子功能
GO:0052903 N(1)-acetylpolyamine oxidase (3-acetamidopropanal-forming) activity 分子功能
GO:1990534 thermospermine oxidase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G65840
ath:AT3G59050
dosa:Os04g0623300
dosa:Os04g0671200
dosa:Os04g0671300
osa:4337046
osa:4337360
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

过氧化物酶体0.368
排名 1 · LXL04_007622 · OH-1004
细胞质0.310
排名 2 · LXL04_007622 · OH-1004
线粒体0.141
排名 3 · LXL04_007622 · OH-1004
细胞核0.105
排名 4 · LXL04_007622 · OH-1004
细胞外0.083
排名 5 · LXL04_007622 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01593.31Amino_oxidase87-459 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_007622PF01593.31Amino_oxidase874592.1e-66225.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8H191拟南芥Probable polyamine oxidase 463.052%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9LYT1拟南芥Polyamine oxidase 359.623%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q0J954水稻Polyamine oxidase 563.804%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q7XR46水稻Polyamine oxidase 459.465%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q7X809水稻Polyamine oxidase 356.341%Swiss-Prot强数据库同源证据

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