LXL04_007584 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_007584

当前版本: OH-1004 染色体: Chr02 坐标: 53193332-53198707 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

621 bp · LXL04_007584|LXL04_007584|OH1004|cDNA

ATGAAAATGGAAACACAACTGACCCTTCTGCGATTGCATACACTTCAACATCTGAACAGTCAATTCCTTCAAGGTAATCAAAGAAGGCATCGTAACATCAACAACAAGATAATTGATATCAATGAAGAATTCGTCAGATTTGattatATAAAAGAAAACCTCTTTGTATCGTGCACCAATTGGATTTCTCGTACAACAATCTCTCCGGCTTGGTTCTGGGAACCGGTCAGTTCAGCTACTTCAATTCTTCTCGTCATCGG...

CDS

下载 CDS FASTA

621 bp · LXL04_007584|LXL04_007584|OH1004|CDS

ATGAAAATGGAAACACAACTGACCCTTCTGCGATTGCATACACTTCAACATCTGAACAGTCAATTCCTTCAAGGTAATCAAAGAAGGCATCGTAACATCAACAACAAGATAATTGATATCAATGAAGAATTCGTCAGATTTGATTATATAAAAGAAAACCTCTTTGTATCGTGCACCAATTGGATTTCTCGTACAACAATCTCTCCGGCTTGGTTCTGGGAACCGGTCAGTTCAGCTACTTCAATTCTTCTCGTCATCGG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

206 aa · LXL04_007584|LXL04_007584|OH1004|PROTEIN

MKMETQLTLLRLHTLQHLNSQFLQGNQRRHRNINNKIIDINEEFVRFDYIKENLFVSCTNWISRTTISPAWFWEPVSSATSILLVIGLLIYSYRLCGCRHSQSSIDQKSRARKFTTFQRLDFTCDDVLDSLKEENIIGKGGVGIVYKGVMPNNEHVEQPKEDDCPVTTPLAPLPRLRDPAPDVARSPTKGFYTWGMPYDNRQRLIS

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_007584`
TK1151 ID	TkA02G507320
OH-1004 ID	LXL04_007584
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)	71.700
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 71.318 / OH-1004 39.320 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_007584

位置 Chr02:53193332-53198707 (+)

描述 Similar to BAM1: Leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase BAM1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g65700`	富含亮氨酸重复序列的受体样激酶，与CLV1和BAM3共同感知CLAVATA类肽CLE25、CLE26和CLE45，经CIK及PBL34、PBL35和PBL36的磷酸化传递信号，调控原生韧皮部分化和分生组织维持。	暂无已核实直接文献
`At3g49670`	富含LRR的类受体激酶（LRR-RLK），涉及CLAVATA家族肽（CLEs）的检测，以及通过CIK蛋白的磷酸化调节触发信号以促进原韧皮部分化和分生组织维持，可能还包括PBL34、PBL35和PBL36。	暂无已核实直接文献
`At1g75820`	富含LRR的类受体激酶（LRR-RLK），类似于BAM1和BAM3，参与CLAVATA家族肽（例如CLV3、CLE25、CLE26和CLE45）的检测，并通过CIK蛋白（CIKs）以及PBL34、PBL35和PBL36的磷酸化调节原韧皮部分化和分生组织维持所需的触发信号。	Stem cell signaling in Arabidopsis requires CRN to localize CLV2 to the plasma membrane.2010 · DOI: 10.1104/pp.109.149930 Receptor-like cytoplasmic kinase MAZZA mediates developmental processes with CLAVATA1 family receptors in Arabidopsis.2021 · DOI: 10.1093/jxb/erab183 A CLE-BAM-CIK signalling module controls root protophloem differentiation in Arabidopsis.2022 · DOI: 10.1111/nph.17791 Receptor-like cytoplasmic kinases PBL34/35/36 are required for CLE peptide-mediated signaling to maintain shoot apical meristem and root apical meristem homeostasis in Arabidopsis.2022 · DOI: 10.1093/plcell/koab315

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_007584 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0007172 signal complex assembly 生物过程

GO:0009755 hormone-mediated signaling pathway 生物过程

GO:0009791 post-embryonic development 生物过程

GO:0009934 regulation of meristem structural organization 生物过程

GO:0010075 regulation of meristem growth 生物过程

GO:0030154 cell differentiation 生物过程

GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程

GO:0036289 peptidyl-serine autophosphorylation 生物过程

GO:0048229 gametophyte development 生物过程

GO:0048437 floral organ development 生物过程

GO:2000037 regulation of stomatal complex patterning 生物过程

GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G75820

ath:AT3G49670

ath:AT5G65700

gmx:732625

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.336

排名 1 · LXL04_007584 · OH-1004

内质网0.234

排名 2 · LXL04_007584 · OH-1004

细胞核0.187

排名 3 · LXL04_007584 · OH-1004

细胞质0.180

排名 4 · LXL04_007584 · OH-1004

高尔基体0.095

排名 5 · LXL04_007584 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

没有找到该查询的结果。

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`O49545`	拟南芥	Leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase BAM1	78.000%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`Q9M2Z1`	拟南芥	Leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase BAM2	70.000%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`Q9SYQ8`	拟南芥	Receptor protein kinase CLAVATA1	53.247%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据

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