LXL04_007460 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_007460

当前版本: OH-1004 染色体: Chr02 坐标: 49116694-49119566 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1134 bp · LXL04_007460|LXL04_007460|OH1004|cDNA

ATGAAGAAGGGAGCTAAGAGAAAGGCTGCTGCGGCGAGCCGTAAGGATGAATTAGCTTCTACTTCTACAGAACCCGCTgccgccgccaccaccaccaccgaaGCACCGGAGGAGCAACATAACAAGGAACACACAAAAGTCGGTCGACCAACAAAACGTTCGAAAGTTCCGAAGCCTGAATCTGAACCCGAGTACTTCGAGGATCAGCGTGAATTGATTGGATTTATGAAGTCAAATTTCAGACATCGAAAATCAAATTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1134 bp · LXL04_007460|LXL04_007460|OH1004|CDS

ATGAAGAAGGGAGCTAAGAGAAAGGCTGCTGCGGCGAGCCGTAAGGATGAATTAGCTTCTACTTCTACAGAACCCGCTGCCGCCGCCACCACCACCACCGAAGCACCGGAGGAGCAACATAACAAGGAACACACAAAAGTCGGTCGACCAACAAAACGTTCGAAAGTTCCGAAGCCTGAATCTGAACCCGAGTACTTCGAGGATCAGCGTGAATTGATTGGATTTATGAAGTCAAATTTCAGACATCGAAAATCAAATTC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

377 aa · LXL04_007460|LXL04_007460|OH1004|PROTEIN

MKKGAKRKAAAASRKDELASTSTEPAAAATTTTEAPEEQHNKEHTKVGRPTKRSKVPKPESEPEYFEDQRELIGFMKSNFRHRKSNSILEDLWKQVFPVGTEWDQLDLLSEYKWNFSNLENAFDEGGVLHGKKVYLFSCTEPQLLFFGGQSKVTCVPVVVAIVSPFPPSDKIGINSVQRESEEILDMKQMKMDWVPYIPYGKRGSSVERLKSQIYILSCVQRRAGLKHLKEDRVKKFEYCLPYFYHPLKEDETEQSTIVD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_007460`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_007460

位置 Chr02:49116694-49119566 (-)

描述 Similar to HIT4: Protein HEAT INTOLERANT 4

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g10010`	维持基础耐热性所必需的蛋白质，尤其在热诱导的染色质中心去凝集期间，因此调控转录基因沉默（TGS）。	Arabidopsis HIT4 encodes a novel chromocentre-localized protein involved in the heat reactivation of transcriptionally silent loci and is essential for heat tolerance in plants.2013 · DOI: 10.1093/jxb/ert030 Arabidopsis HIT4, a regulator involved in heat-triggered reorganization of chromatin and release of transcriptional gene silencing, relocates from chromocenters to the nucleolus in response to heat stress.2015 · DOI: 10.1111/nph.13088

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_007460 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009408 response to heat 生物过程

GO:0010286 heat acclimation 生物过程

GO:0031452 negative regulation of heterochromatin formation 生物过程

GO:0045814 negative regulation of gene expression, epigenetic 生物过程

GO:1900034 regulation of cellular response to heat 生物过程

GO:0005730 nucleolus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0010369 chromocenter 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT5G10010

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.781

排名 1 · LXL04_007460 · OH-1004

细胞质0.248

排名 2 · LXL04_007460 · OH-1004

线粒体0.047

排名 3 · LXL04_007460 · OH-1004

细胞膜0.045

排名 4 · LXL04_007460 · OH-1004

内质网0.024

排名 5 · LXL04_007460 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

没有找到该查询的结果。

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`A2RVJ8`	拟南芥	Protein HEAT INTOLERANT 4	57.367%	Swiss-Prot	强数据库同源证据

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