基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_006886
当前版本: OH-1004
染色体: Chr02
坐标: 28688294-28696158
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA3432 bp · LXL04_006886|LXL04_006886|OH1004|cDNA
ATGTTACCTGCACCTATCAAGAATACAAATTCCTCATCCTCTTCCGTACTGCCAGACCAGAGATGTCAACATTTTACTGTCGCTGAGATTGTATCGGCAACAAACAACTTCGACAAGAGTTTAGTAATCGGCCGTGGAGGATTCGGGAAGGTGTATAAAGGCCGCATCAAGATTGGGTCAGTAAGCGAAGTTGCAATTAAACGATTGCGTTCCAACTCCAATCAAGGAGCCCATGAATTTGAAGCTGAAGTTCAGGTTCT...
CDS
下载 CDS FASTA3432 bp · LXL04_006886|LXL04_006886|OH1004|CDS
ATGTTACCTGCACCTATCAAGAATACAAATTCCTCATCCTCTTCCGTACTGCCAGACCAGAGATGTCAACATTTTACTGTCGCTGAGATTGTATCGGCAACAAACAACTTCGACAAGAGTTTAGTAATCGGCCGTGGAGGATTCGGGAAGGTGTATAAAGGCCGCATCAAGATTGGGTCAGTAAGCGAAGTTGCAATTAAACGATTGCGTTCCAACTCCAATCAAGGAGCCCATGAATTTGAAGCTGAAGTTCAGGTTCT...
1143 aa · LXL04_006886|LXL04_006886|OH1004|PROTEIN
MLPAPIKNTNSSSSSVLPDQRCQHFTVAEIVSATNNFDKSLVIGRGGFGKVYKGRIKIGSVSEVAIKRLRSNSNQGAHEFEAEVQVLSKLRHGNLVSLIGFCKKGNKMALVYEFMPNGTLEEKLHKPDSFLSLLQRLKICIGAARGLDYLHTGTSTQHGVIHRDVKSSNILLDANFDAKIADFGLARFGLIDRTHVSTAVKGTFGYMDPCYFYTGKLTTSSDVYAFGVVLFEVLTGKKAVDSTLDEEQWGLAPWAQHQIK...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_006886 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_006886 | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr02:28688294-28696158 (+) | ||||||||||||||||||
| 描述 | 暂无功能描述 | ||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | ||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0009723 response to ethylene 生物过程 GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程 GO:0009741 response to brassinosteroid 生物过程 GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程 GO:0009788 negative regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程 GO:0009791 post-embryonic development 生物过程 GO:0009873 ethylene-activated signaling pathway 生物过程 GO:0010038 response to metal ion 生物过程 GO:0010118 stomatal movement 生物过程 GO:0010483 pollen tube reception 生物过程 GO:0030308 negative regulation of cell growth 生物过程 GO:0032922 circadian regulation of gene expression 生物过程 | ||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT3G51550 ath:AT5G39000 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞质0.521
细胞膜0.328
细胞核0.268
内质网0.049
溶酶体／液泡0.042
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00069.32Pkinase41-306 aaPF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr42-307 aaPF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr413-646 aaPF00069.32Pkinase414-645 aaPF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr735-1001 aaPF00069.32Pkinase735-999 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_006886 | PF00069.32 | Pkinase | 41 | 306 | 1.3e-97 | 327.1 |
| LXL04_006886 | PF07714.24 | PK_Tyr_Ser-Thr | 42 | 307 | 4.8e-112 | 374.2 |
| LXL04_006886 | PF07714.24 | PK_Tyr_Ser-Thr | 413 | 646 | 4.8e-112 | 374.2 |
| LXL04_006886 | PF00069.32 | Pkinase | 414 | 645 | 1.3e-97 | 327.1 |
| LXL04_006886 | PF07714.24 | PK_Tyr_Ser-Thr | 735 | 1001 | 4.8e-112 | 374.2 |
| LXL04_006886 | PF00069.32 | Pkinase | 735 | 999 | 1.3e-97 | 327.1 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9SCZ4 | 拟南芥 | Receptor-like protein kinase FERONIA | 52.778% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q9FID8 | 拟南芥 | Putative receptor-like protein kinase At5g39000 | 49.686% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q9FID9 | 拟南芥 | Probable receptor-like protein kinase At5g38990 | 50.321% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q9SR05 | 拟南芥 | Receptor-like protein kinase ANXUR1 | 50.658% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q3E8W4 | 拟南芥 | Receptor-like protein kinase ANXUR2 | 50.993% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |