基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_006383
当前版本: OH-1004
染色体: Chr02
坐标: 9217564-9225774
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA2931 bp · LXL04_006383|LXL04_006383|OH1004|cDNA
ATGGATTCAAATGCTAAGATCTCGATTTTGGAAGGAACGGATGAACTCAAACTCCGAAATGATTCAAATGCGACTGTCTTGCAATCGGGAATGCTTGATGAAAAGGGTGGCGACGGCGagtcaagatcttttgagaactcatatattcccgagaacccgagaactcccaaaccgttaactttttcgaaaaaccgacttcggggggctaaaaatcgctcaaatataagcccggtcgcaaaaaaaaaatttccgaaaaaacg...
CDS
下载 CDS FASTA2931 bp · LXL04_006383|LXL04_006383|OH1004|CDS
ATGGATTCAAATGCTAAGATCTCGATTTTGGAAGGAACGGATGAACTCAAACTCCGAAATGATTCAAATGCGACTGTCTTGCAATCGGGAATGCTTGATGAAAAGGGTGGCGACGGCGAGTCAAGATCTTTTGAGAACTCATATATTCCCGAGAACCCGAGAACTCCCAAACCGTTAACTTTTTCGAAAAACCGACTTCGGGGGGCTAAAAATCGCTCAAATATAAGCCCGGTCGCAAAAAAAAAATTTCCGAAAAAACG...
976 aa · LXL04_006383|LXL04_006383|OH1004|PROTEIN
MDSNAKISILEGTDELKLRNDSNATVLQSGMLDEKGGDGESRSFENSYIPENPRTPKPLTFSKNRLRGAKNRSNISPVAKKKFPKKRLFFSKNFAYVQTFFFVHMSLYNTYLKRFVKKKFEKKRKKKSCTYAQKIKKSCTYAKVKKNIRIVMIKNVLEGSEVVRTIIKFENGGTNLDRYKSHTAALRRQKIDLRQTGISGLDSFLHCVQEDGTAVMEVARSSFEEELHPKNKFPFNSMSQDYIFNFSHGFERPSSQDQQQ...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_006383 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_006383 | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr02:9217564-9225774 (-) | ||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to BLH6: BEL1-like homeodomain protein 6 | ||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | ||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程 GO:0006357 regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程 GO:0048481 plant ovule development 生物过程 GO:0048510 regulation of timing of transition from vegetative to reproductive phase 生物过程 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005829 cytosol 细胞组分 GO:0009506 plasmodesma 细胞组分 GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能 GO:0000978 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding 分子功能 GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity 分子功能 | ||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G19700 ath:AT1G75410 ath:AT2G16400 ath:AT4G34610 ath:AT5G41410 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞核0.916
细胞质0.166
细胞膜0.027
线粒体0.019
内质网0.014
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF07526.17POX529-660 aaPF05920.18Homeobox_KN729-768 aaPF00046.36Homeodomain736-768 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_006383 | PF07526.17 | POX | 529 | 660 | 3.5e-49 | 167.5 |
| LXL04_006383 | PF05920.18 | Homeobox_KN | 729 | 768 | 3.3e-19 | 69.2 |
| LXL04_006383 | PF00046.36 | Homeodomain | 736 | 768 | 5.7e-07 | 30.0 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
O65685 | 拟南芥 | BEL1-like homeodomain protein 6 | 55.882% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q38897 | 拟南芥 | Homeobox protein BEL1 homolog | 52.222% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q9FXG8 | 拟南芥 | BEL1-like homeodomain protein 10 | 53.069% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q9SIW1 | 拟南芥 | BEL1-like homeodomain protein 7 | 51.379% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q9FWS9 | 拟南芥 | BEL1-like homeodomain protein 3 | 52.577% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |