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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_005748
当前版本: OH-1004 染色体: Chr01 坐标: 172655974-172657716 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1644 bp · LXL04_005748|LXL04_005748|OH1004|cDNA

ATGTCAGTTGCTGACGTTGCTTTGAGTCCAATTCACAAAAGGCCCGGCTCCGTTTGTTCACGGAGCAGTGAATCCATCGTGATTTACTTAACAATTGCAGGTTCCGTGATTCCAATGAGAATTATGGAATCCGATTCCATTGCCACCGTGAAACTAAGGATTCAGACGTGTAAAGGATTTGTAGTGAAGAAACAAAAGCTTGTTTTCGAAGGGAGAGAATTATCAAGAAATAATTCTCTTTTGAAAGACTATGGTGTTTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1644 bp · LXL04_005748|LXL04_005748|OH1004|CDS

ATGTCAGTTGCTGACGTTGCTTTGAGTCCAATTCACAAAAGGCCCGGCTCCGTTTGTTCACGGAGCAGTGAATCCATCGTGATTTACTTAACAATTGCAGGTTCCGTGATTCCAATGAGAATTATGGAATCCGATTCCATTGCCACCGTGAAACTAAGGATTCAGACGTGTAAAGGATTTGTAGTGAAGAAACAAAAGCTTGTTTTCGAAGGGAGAGAATTATCAAGAAATAATTCTCTTTTGAAAGACTATGGTGTTTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

547 aa · LXL04_005748|LXL04_005748|OH1004|PROTEIN

MSVADVALSPIHKRPGSVCSRSSESIVIYLTIAGSVIPMRIMESDSIATVKLRIQTCKGFVVKKQKLVFEGRELSRNNSLLKDYGVSSGDVLHLILRVSDLLMITVDTAIGKAFEFEVDRFRNVKYLKELVEEKAKGIGFVNGEDLKILCNGEKLDDERLIDDICKNHDAVIHLVVQKSSPYERNPKKDEKKTNPKKPPDIDFPLQPIVVNPDSKLSPDISNMLDSASEGLQKGKKPIISSEGTGGTYFMQHPSGNKYVA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_005748
TK1151 IDTkA01G019180
OH-1004 IDLXL04_005748
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)98.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_005748
位置Chr01:172655974-172657716 (+)
描述Similar to PI4KG2: Phosphatidylinositol 4-kinase gamma 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: Q9SGW8 磷脂酰肌醇 (PI) 被磷酸化为 PI4P 是生成磷脂酰肌醇 4,5-二磷酸 (PIP2) 的第一步承诺步骤，PIP2 是第二信使肌醇 1,4,5-三磷酸 (InsP3) 的前体。 暂无已核实直接文献
At2g46500 将磷脂酰肌醇（PI）磷酸化为PI4P是生成磷脂酰肌醇4,5-二磷酸（PIP2）的第一步，这是第二信使肌醇1,4,5-三磷酸（InsP3）的前体（通过相似性推测）。
Characterization of a new family of protein kinases from Arabidopsis containing phosphoinositide 3/4-kinase and ubiquitin-like domains.2008 · DOI: 10.1042/bj20070959
At5g24240 磷脂酰肌醇 (PI) 被磷酸化为 PI4P 是生成磷脂酰肌醇 4,5-二磷酸 (PIP2) 的第一步承诺步骤，PIP2 是第二信使肌醇 1,4,5-三磷酸 (InsP3) 的前体。 暂无已核实直接文献
At1g13640 磷脂酰肌醇 (PI) 被磷酸化为 PI4P 是生成磷脂酰肌醇 4,5-二磷酸 (PIP2) 的第一步承诺步骤，PIP2 是第二信使肌醇 1,4,5-三磷酸 (InsP3) 的前体。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0290500 将磷脂酰肌醇（PI）磷酸化为PI4P是生成磷脂酰肌醇4,5-二磷酸（PIP2）的第一步，这是第二信使肌醇1,4,5-三磷酸（InsP3）的前体（通过相似性推测）。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_005748 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009908 flower development 生物过程
GO:0009909 regulation of flower development 生物过程
GO:0034051 negative regulation of plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0046854 phosphatidylinositol phosphate biosynthetic process 生物过程
GO:0048364 root development 生物过程
GO:0048579 negative regulation of long-day photoperiodism, flowering 生物过程
GO:0050821 protein stabilization 生物过程
GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程
GO:1902074 response to salt 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G13640
ath:AT2G46500
ath:AT5G24240
dosa:Os02g0290500
osa:4329058
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.396
排名 1 · LXL04_005748 · OH-1004
细胞核0.283
排名 2 · LXL04_005748 · OH-1004
细胞膜0.231
排名 3 · LXL04_005748 · OH-1004
内质网0.131
排名 4 · LXL04_005748 · OH-1004
高尔基体0.108
排名 5 · LXL04_005748 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00240.30ubiquitin33-98 aa
PF11976.15Rad60-SLD35-96 aa
PF00240.30ubiquitin104-178 aa
PF00454.34PI3_PI4_kinase244-491 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_005748PF00240.30ubiquitin33981.9e-2279.5
LXL04_005748PF11976.15Rad60-SLD35962.2e-0731.3
LXL04_005748PF00240.30ubiquitin1041781.9e-2279.5
LXL04_005748PF00454.34PI3_PI4_kinase2444912.2e-44152.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SGW8拟南芥Phosphatidylinositol 4-kinase gamma 257.168%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9ZPY9拟南芥Phosphatidylinositol 4-kinase gamma 456.514%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9FNF8拟南芥Phosphatidylinositol 4-kinase gamma 354.593%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q8W4R8拟南芥Phosphatidylinositol 4-kinase gamma 640.909%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q6K881水稻Phosphatidylinositol 4-kinase gamma 454.128%Swiss-Prot强数据库同源证据

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