基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_001781
当前版本: OH-1004
染色体: Chr01
坐标: 33289990-33298155
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA855 bp · LXL04_001781|LXL04_001781|OH1004|cDNA
ATGTCCTCGAACCCGGTCCAACACCAGCGTACGAAGCACATAGAGATTGACATTCATTTTGTTCGTGATCTGGTGGCACGAGGAGTCGTTCGTGTTTTTCACGTACCGTCATCCGCTCAGTATGCCGACATATTCACCAAAGGCCTTCCGACGCAACTCTTCAACGAATTCAAGACCAGCAAGGCATACATCAATTTGATGGAAAGAACATGGCACGATGTATGTCCATATGATGCCATGATTGTGACATGTGAATATTG...
CDS
下载 CDS FASTA855 bp · LXL04_001781|LXL04_001781|OH1004|CDS
ATGTCCTCGAACCCGGTCCAACACCAGCGTACGAAGCACATAGAGATTGACATTCATTTTGTTCGTGATCTGGTGGCACGAGGAGTCGTTCGTGTTTTTCACGTACCGTCATCCGCTCAGTATGCCGACATATTCACCAAAGGCCTTCCGACGCAACTCTTCAACGAATTCAAGACCAGCAAGGCATACATCAATTTGATGGAAAGAACATGGCACGATGTATGTCCATATGATGCCATGATTGTGACATGTGAATATTG...
284 aa · LXL04_001781|LXL04_001781|OH1004|PROTEIN
MSSNPVQHQRTKHIEIDIHFVRDLVARGVVRVFHVPSSAQYADIFTKGLPTQLFNEFKTSKAYINLMERTWHDVCPYDAMIVTCEYCGSIVTSPNRPTQIVPILSRQYCDIGLDEADHILLSCPVISDALDWILQWCNVPTQNFSSVSDFVNFAASWGNCPKKKKIFLAVCYGFLWSAWKARNDKRFKNIRCGVAQLWITSSTFPSSHLSDPQISSSLRSSASSLALSASTHESISCTLQIRSSNPSDVTALQTSYNINK...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_001781 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_001781 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr01:33289990-33298155 (-) | |||||||||
| 描述 | Similar to RE1: Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon RE1 | |||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | |||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006281 DNA repair 生物过程 GO:0006310 DNA recombination 生物过程 GO:0006508 proteolysis 生物过程 GO:0015074 DNA integration 生物过程 GO:0071897 DNA biosynthetic process 生物过程 GO:0042575 DNA polymerase complex 细胞组分 GO:0003676 nucleic acid binding 分子功能 GO:0003964 RNA-directed DNA polymerase activity 分子功能 GO:0004190 aspartic-type endopeptidase activity 分子功能 GO:0004519 endonuclease activity 分子功能 GO:0005524 ATP binding 分子功能 GO:0008270 zinc ion binding 分子功能 | |||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | 暂无功能描述 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞质0.441
细胞核0.403
线粒体0.095
细胞膜0.085
内质网0.069
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
没有找到该查询的结果。
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。