基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_001279
当前版本: OH-1004
染色体: Chr01
坐标: 23396295-23397634
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA843 bp · LXL04_001279|LXL04_001279|OH1004|cDNA
ATGGTTGCTGCCGACTTTGTCGTCGGGATCTTAGGAAACATCGTCTCTATACTCAGTTTCACTTCTCCCATATCACAATTTCGGGAGATTGTGAAGGGAAAAAATGCTGATAACTACAACGGAACACCATATATTGCAACGTTTTTGAGTTGTTCTTTGTGGATTTTGTACGGAGTACTTGACCCAGATGATGGTCTCCTCATTGTGACTGTCAACTCAGCTGGTGTGGGCATGCAAACCCTCTACCTTGCTCTACTTTT...
CDS
下载 CDS FASTA843 bp · LXL04_001279|LXL04_001279|OH1004|CDS
ATGGTTGCTGCCGACTTTGTCGTCGGGATCTTAGGAAACATCGTCTCTATACTCAGTTTCACTTCTCCCATATCACAATTTCGGGAGATTGTGAAGGGAAAAAATGCTGATAACTACAACGGAACACCATATATTGCAACGTTTTTGAGTTGTTCTTTGTGGATTTTGTACGGAGTACTTGACCCAGATGATGGTCTCCTCATTGTGACTGTCAACTCAGCTGGTGTGGGCATGCAAACCCTCTACCTTGCTCTACTTTT...
280 aa · LXL04_001279|LXL04_001279|OH1004|PROTEIN
MVAADFVVGILGNIVSILSFTSPISQFREIVKGKNADNYNGTPYIATFLSCSLWILYGVLDPDDGLLIVTVNSAGVGMQTLYLALLFIYSSPEKRVKYFGFVVLDVVCFGLVVAFTLVAFHGESRRTFTGVICATFTTMMYAAPLAALRTTIKTKSVEYMPILLVFSLFVNGCVWLTFALLVTDVFVLVPNAIGILLGAIQFCVYLMFRNSRPIVNEKQTEIQEFGTEDIDVKSNNMITQKRSLSRLDAFPVIRSPSLLS...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_001279 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_001279 | |||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr01:23396295-23397634 (+) | |||||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to SWEET16: Bidirectional sugar transporter SWEET16 | |||||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| |||||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程 GO:0006995 cellular response to nitrogen starvation 生物过程 GO:0007623 circadian rhythm 生物过程 GO:0008643 carbohydrate transport 生物过程 GO:0009409 response to cold 生物过程 GO:0009646 response to absence of light 生物过程 GO:0009734 auxin-activated signaling pathway 生物过程 GO:0009744 response to sucrose 生物过程 GO:0009749 response to glucose 生物过程 GO:0009750 response to fructose 生物过程 GO:0010930 negative regulation of auxin mediated signaling pathway 生物过程 GO:0015755 fructose transmembrane transport 生物过程 | |||||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT3G16690 ath:AT4G15920 dosa:Os03g0341300 dosa:Os05g0588500 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞膜0.618
内质网0.150
溶酶体／液泡0.134
细胞质0.101
高尔基体0.070
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF03083.22MtN3_slv7-93 aaPF03083.22MtN3_slv129-211 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_001279 | PF03083.22 | MtN3_slv | 7 | 93 | 5.6e-44 | 148.8 |
| LXL04_001279 | PF03083.22 | MtN3_slv | 129 | 211 | 5.6e-44 | 148.8 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9LUR4 | 拟南芥 | Bidirectional sugar transporter SWEET16 | 38.767% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q84WN3 | 拟南芥 | Bidirectional sugar transporter SWEET17 | 35.950% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q10LN5 | 水稻 | Bidirectional sugar transporter SWEET16 | 44.601% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
A2YZ24 | 水稻 | Bidirectional sugar transporter SWEET7b | 35.526% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q6L568 | 水稻 | Bidirectional sugar transporter SWEET5 | 37.668% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |