LXL04_000691 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_000691

当前版本: OH-1004 染色体: Chr01 坐标: 12748487-12749264 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

468 bp · LXL04_000691|LXL04_000691|OH1004|cDNA

ATGGTCTTATCCCCCGATATGAGTTCACCCCGGCGACCGCAGGCGCGTGCGCGCGTAAATTCCTCGTCGGAGACTCATCGATCGGATGTGCAATCGGGAAGTTTAGAGTCGTCGTTGCTCCGGCTCGTCAATGATCATCAGAATACCGCTTTACGACTTCGAGAACACACAGAGAAATCGAAGAAAGAAGCGATCAAGAGCGCTTCTCGGGTATCGGATCTGTTAGTGGAGGCTGTTAATGGAGATGTGGAAGAATGTTT...

CDS

下载 CDS FASTA

468 bp · LXL04_000691|LXL04_000691|OH1004|CDS

ATGGTCTTATCCCCCGATATGAGTTCACCCCGGCGACCGCAGGCGCGTGCGCGCGTAAATTCCTCGTCGGAGACTCATCGATCGGATGTGCAATCGGGAAGTTTAGAGTCGTCGTTGCTCCGGCTCGTCAATGATCATCAGAATACCGCTTTACGACTTCGAGAACACACAGAGAAATCGAAGAAAGAAGCGATCAAGAGCGCTTCTCGGGTATCGGATCTGTTAGTGGAGGCTGTTAATGGAGATGTGGAAGAATGTTT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

155 aa · LXL04_000691|LXL04_000691|OH1004|PROTEIN

MVLSPDMSSPRRPQARARVNSSSETHRSDVQSGSLESSLLRLVNDHQNTALRLREHTEKSKKEAIKSASRVSDLLVEAVNGDVEECFVNEKRIEVEIRALKTTIKRFAKQTDLWLASTHAINNAIKEIGDFENWMKTMELDCKSITAAISNIHQS

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_000691`
TK1151 ID	TkA01G593430
OH-1004 ID	LXL04_000691
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	99.300
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 96.129 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_000691

位置 Chr01:12748487-12749264 (-)

描述 Similar to BLOS1: Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At2g30330`	溶酶体相关细胞器生物发生复合物1（BLOC-1）的组分；该复合物经由内体至液泡的细胞内囊泡运输，介导液泡降解性运输。	BLOS1, a putative BLOC-1 subunit, interacts with SNX1 and modulates root growth in Arabidopsis.2010 · DOI: 10.1242/jcs.069732

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000691 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009060 aerobic respiration 生物过程

GO:0016197 endosomal transport 生物过程

GO:0018394 peptidyl-lysine acetylation 生物过程

GO:0032418 lysosome localization 生物过程

GO:0032438 melanosome organization 生物过程

GO:0045324 late endosome to vacuole transport 生物过程

GO:0048364 root development 生物过程

GO:0051036 regulation of endosome size 生物过程

GO:0060155 platelet dense granule organization 生物过程

GO:0062196 regulation of lysosome size 生物过程

GO:0072384 organelle transport along microtubule 生物过程

GO:0005615 extracellular space 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G30330

hsa:2647

mmu:14533

pon:100190807

xtr:779698

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.721

排名 1 · LXL04_000691 · OH-1004

细胞核0.290

排名 2 · LXL04_000691 · OH-1004

细胞膜0.065

排名 3 · LXL04_000691 · OH-1004

溶酶体／液泡0.060

排名 4 · LXL04_000691 · OH-1004

高尔基体0.053

排名 5 · LXL04_000691 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF06320.19GCN5L142-154 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_000691	`PF06320.19`	GCN5L1	42	154	1.7e-39	135.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`O22929`	拟南芥	Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 1	68.421%	Swiss-Prot	强数据库同源证据

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