GO / KEGG 统计富集
在明确的原生基因背景上计算过度代表分析;基因注释与统计结果分开显示。
示例来自当前注释中的12个萜类骨架通路候选基因,仅用于演示。TK1151和OH1004独立分析,不自动跨材料转移或合并基因。
默认背景为所选GO类别或KEGG通路中有当前注释的原生基因;自定义背景也与同一注释集合取交集。缺失注释不等于缺失功能,当前注释覆盖范围会限制分析。
方法、来源与解释范围
独立使用两套原生蛋白的首位Swiss-Prot拟南芥同源命中,阈值为Identity≥30%、Query coverage≥70%、E≤10⁻⁵。该注释集较保守,未达到阈值的其他基因仍保留在网站原始同源与注释模块中。GO剔除过时条目,规范化别名,并按固定的橡胶草物种约束筛查;仅沿is_a与part_of上溯。KEGG依据供体基因的KO与真实拟南芥通路映射,不把供体基因ID当作通路ID。
同源转移不等于已确认的直系同源或本物种实验功能。富集反映当前注释集合中的统计过度代表,不证明调控、通路激活或因果机制。转录组或蛋白组分析建议提交实验实际可检测的背景基因。
GO data-version: releases/2026-07-26 · 已排除的动物相关KEGG通路: ath04820, ath04620, ath04382, ath05100
查看源文件与SHA-256
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橡胶草物种约束文件SHA-256: 6e0c25c39c237c8e9223174f09420ac21f12b9f6ae5bccc9f431337f3da3fc5c