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基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

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基因 IDTkA08G077720
当前查询版本TK1151
位置Chr08:19908314-19911397 (+)
描述Similar to At5g48730: Pentatricopeptide repeat-containing protein At5g48730%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_018675 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g48730 含有五肽重复序列的叶绿体蛋白质 At5g48730。 暂无已核实直接文献
At3g53170 含五肽重复结构的蛋白 At3g53170。 暂无已核实直接文献
At3g06430 含五次肽重复序列的蛋白At3g06430,叶绿体定位。 暂无已核实直接文献
At4g30825 含五重复肽的蛋白At4g30825,叶绿体。 暂无已核实直接文献
At5g36300 推测的含五肽重复的蛋白 At5g36300。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0006397mRNA processing生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=28.28; 覆盖度=71.608; E 值=8.48e-45; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009553embryo sac development生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=43.909; 覆盖度=82.255; E 值=2.18e-112; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009555pollen development生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=43.909; 覆盖度=82.255; E 值=2.18e-112; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009793embryo development ending in seed dormancy生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=43.909; 覆盖度=82.255; E 值=2.18e-112; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0048868pollen tube development生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=43.909; 覆盖度=82.255; E 值=2.18e-112; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005730nucleolus细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=46.575; 覆盖度=91.441; E 值=3.65e-135; UniProt GO evidence=HDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005737cytoplasm细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=28.28; 覆盖度=71.608; E 值=8.48e-45; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005739mitochondrion细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=46.575; 覆盖度=91.441; E 值=3.65e-135; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009507chloroplast细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.88; 覆盖度=92.484; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003729mRNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.88; 覆盖度=92.484; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0019843rRNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=43.909; 覆盖度=82.255; E 值=2.18e-112; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G06430KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=43.909; 覆盖度=82.255; E 值=2.18e-112UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G53170KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=46.575; 覆盖度=91.441; E 值=3.65e-135UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT4G39620KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=28.28; 覆盖度=71.608; E 值=8.48e-45UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G48730KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.88; 覆盖度=92.484; E 值=0.0UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release