基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA04G019820 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr04:4962556-4963146 (+) |
| 描述 | Similar to LSH6: Protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 6 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_036869 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 12 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g31160 |
可能的转录调节因子，通过促进细胞在光照下的生长作为发育调控因子（相似性推测）。 | |
At5g28490 |
可能的转录调控因子，至少在幼苗发育阶段，以依赖光敏色素的方式促进持续红光（cR）、远红光（cFR）和蓝光（cB）条件下的细胞生长。 | |
At3g04510 |
可能的转录调控因子，通过响应光促进细胞生长作为发育调控因子。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g23290 |
可能的转录调节因子，通过促进细胞在光照下的生长作为发育调控因子（相似性推测）。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
UniProt: A2XAV5 |
可能的转录调控因子，通过响应光促进细胞生长作为发育调控因子。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009299 | mRNA transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.37; 覆盖度=82.653; E 值=1.26e-80; UniProt GO evidence=ISS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009416 | response to light stimulus | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.37; 覆盖度=82.653; E 值=1.26e-80; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010199 | organ boundary specification between lateral organs and the meristem | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=67.692; 覆盖度=99.49; E 值=7.31e-78; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010492 | maintenance of shoot apical meristem identity | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=67.692; 覆盖度=99.49; E 值=7.31e-78; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045892 | negative regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=88.06; 覆盖度=68.367; E 值=1.02e-77; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048441 | petal development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=67.692; 覆盖度=99.49; E 值=7.31e-78; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048834 | specification of petal number | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=67.692; 覆盖度=99.49; E 值=7.31e-78; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0080050 | regulation of seed development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=88.06; 覆盖度=68.367; E 值=1.02e-77; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0090698 | post-embryonic plant morphogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.37; 覆盖度=82.653; E 值=1.26e-80; UniProt GO evidence=ISS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.37; 覆盖度=82.653; E 值=1.26e-80; UniProt GO evidence=ISS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003677 | DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.37; 覆盖度=82.653; E 值=1.26e-80; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042803 | protein homodimerization activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=88.06; 覆盖度=68.367; E 值=1.02e-77; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G07090 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.37; 覆盖度=82.653; E 值=1.26e-80 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G31160 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=67.692; 覆盖度=99.49; E 值=7.31e-78 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G58500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=77.778; 覆盖度=68.878; E 值=6.79e-76 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os02g0811000 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=88.06; 覆盖度=68.367; E 值=1.02e-77 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |