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基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

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基因 IDTkA01G102410
当前查询版本TK1151
位置Chr01:25940168-25948028 (-)
描述Similar to 33 kDa ribonucleoprotein%2C chloroplastic (Nicotiana sylvestris OX%3D4096)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_004841 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 14 条 GO 注释和 1 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g52380 可能参与叶绿体RNA的剪接和/或加工。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0006397mRNA processing生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.277; 覆盖度=53.409; E 值=2.16e-95; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009451RNA modification生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=41.398; 覆盖度=52.841; E 值=8.99e-45; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBAUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0031425chloroplast RNA processing生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=64.22; 覆盖度=61.932; E 值=6.26e-95; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0045087innate immune response生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=41.398; 覆盖度=52.841; E 值=8.99e-45; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBAUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:1901259chloroplast rRNA processing生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.277; 覆盖度=53.409; E 值=2.16e-95; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafterUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005829cytosol细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=64.22; 覆盖度=61.932; E 值=6.26e-95; UniProt GO evidence=HDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009507chloroplast细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=64.22; 覆盖度=61.932; E 值=6.26e-95; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009535chloroplast thylakoid membrane细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.277; 覆盖度=53.409; E 值=2.16e-95; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafterUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009570chloroplast stroma细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=64.22; 覆盖度=61.932; E 值=6.26e-95; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009579thylakoid细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=64.22; 覆盖度=61.932; E 值=6.26e-95; UniProt GO evidence=HDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:1990904ribonucleoprotein complex细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.277; 覆盖度=53.409; E 值=2.16e-95; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003723RNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=64.22; 覆盖度=61.932; E 值=6.26e-95; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003729mRNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.277; 覆盖度=53.409; E 值=2.16e-95; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafterUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0008266poly(U) RNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=41.398; 覆盖度=52.841; E 值=8.99e-45; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBAUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G52380KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=64.22; 覆盖度=61.932; E 值=6.26e-95UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release