基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_036693 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr08:46735306-46736820 (+) |
| 描述 | Similar to STR4A: Rhodanese-like domain-containing protein 4A%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_036693 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 7 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g25480 |
Rhodanese样结构域含蛋白4A,叶绿体。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g01050 |
含有罗丹酶结构域的蛋白质,是将铁氧还蛋白 - NADP 还原酶锚定到类囊体膜上并维持有效的线性电子流 所需的。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
UniProt: A2X345 |
含Rhodanese结构域的蛋白,负责将铁氧还蛋白- NADP还原酶锚定到类囊体膜上,并维持高效的线性电子流(LEF)。 | 暂无已核实直接文献 |
Os02g0257300 |
含Rhodanese结构域的蛋白,负责将铁氧还蛋白- NADP还原酶锚定到类囊体膜上,并维持高效的线性电子流(LEF)。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009772 | photosynthetic electron transport in photosystem II | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=43.558; 覆盖度=48.083; E 值=1.36e-27; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=43.558; 覆盖度=48.083; E 值=1.36e-27; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.199; 覆盖度=59.292; E 值=1.06e-79; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009534 | chloroplast thylakoid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=43.558; 覆盖度=48.083; E 值=1.36e-27; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009535 | chloroplast thylakoid membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.199; 覆盖度=59.292; E 值=1.06e-79; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009941 | chloroplast envelope | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=43.558; 覆盖度=48.083; E 值=1.36e-27; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0098807 | chloroplast thylakoid membrane protein complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=43.558; 覆盖度=48.083; E 值=1.36e-27; UniProt GO evidence=ISS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G25480 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.199; 覆盖度=59.292; E 值=1.06e-79 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G01050 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=43.558; 覆盖度=48.083; E 值=1.36e-27 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os02g0257300 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=45.217; 覆盖度=33.923; E 值=4.85e-24 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | osa:4328925 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=45.217; 覆盖度=33.923; E 值=4.85e-24 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |