基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_035439 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr08:22473383-22476987 (-) |
| 描述 | Similar to CSLD3: Cellulose synthase-like protein D3 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_035439 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 14 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g03050 |
被认为是定位于高尔基体的β-聚糖合酶,催化植物细胞壁非纤维素多糖(半纤维素)主链的聚合。 | |
At5g16910 |
被认为是定位于高尔基体的β-聚糖合酶,催化植物细胞壁非纤维素多糖(半纤维素)主链的聚合。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
UniProt: A2YU42 |
被认为是定位于高尔基体的β-聚糖合酶,催化植物细胞壁非纤维素多糖(半纤维素)主链的聚合。 | 暂无已核实直接文献 |
Os06g0111800 |
被认为是定位于高尔基体的β-聚糖合酶,催化植物细胞壁非纤维素多糖(半纤维素)主链的聚合。 | 暂无已核实直接文献 |
Os10g0578200 |
被认为是定位于高尔基体的β-聚糖合酶,催化植物细胞壁非纤维素多糖(半纤维素)主链的聚合。 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009409 | response to cold | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=81.857; 覆盖度=100.342; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009833 | plant-type primary cell wall biogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=81.857; 覆盖度=100.342; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030244 | cellulose biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=81.857; 覆盖度=100.342; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048767 | root hair elongation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=80.681; 覆盖度=100.427; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0071555 | cell wall organization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=81.857; 覆盖度=100.342; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0071669 | plant-type cell wall organization or biogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=77.666; 覆盖度=101.795; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000139 | Golgi membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=81.857; 覆盖度=100.342; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005768 | endosome | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=81.857; 覆盖度=100.342; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005783 | endoplasmic reticulum | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=81.857; 覆盖度=100.342; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005794 | Golgi apparatus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=81.857; 覆盖度=100.342; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005802 | trans-Golgi network | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=81.857; 覆盖度=100.342; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=81.857; 覆盖度=100.342; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016760 | cellulose synthase (UDP-forming) activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=81.857; 覆盖度=100.342; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051753 | mannan synthase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=81.857; 覆盖度=100.342; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G03050 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=81.857; 覆盖度=100.342; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G16910 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=80.681; 覆盖度=100.427; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os06g0111800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=77.666; 覆盖度=101.795; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os10g0578200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=74.486; 覆盖度=99.829; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | osa:4339895 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=77.666; 覆盖度=101.795; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |