基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_031602 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr07:8183940-8187843 (-) |
| 描述 | Similar to ATL6: E3 ubiquitin-protein ligase ATL6 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_031602 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 15 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g05200 |
E3 泛素蛋白连接酶,能够与泛素结合酶 E2 UBC8 在体外催化多泛素化反应。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g35330 |
RING-H2 指蛋白 ATL34。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g35420 |
RING-H2指蛋白ATL28。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g04240 |
在翻译后水平上对脱落酸稳态的作用,可能是通过泛素/蛋白酶体依赖性底物特异性降解。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os03g0188200 |
在体外具有 E3 泛素蛋白连接酶。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006970 | response to osmotic stress | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=38.889; 覆盖度=13.466; E 值=6.79e-08; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009651 | response to salt stress | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=38.889; 覆盖度=13.466; E 值=6.79e-08; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009687 | abscisic acid metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=38.889; 覆盖度=13.466; E 值=6.79e-08; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009688 | abscisic acid biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=38.889; 覆盖度=13.466; E 值=6.79e-08; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009739 | response to gibberellin | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=38.889; 覆盖度=13.466; E 值=6.79e-08; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016567 | protein ubiquitination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.0; 覆盖度=12.469; E 值=1.32e-08; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042742 | defense response to bacterium | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.0; 覆盖度=12.469; E 值=1.32e-08; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0098542 | defense response to other organism | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.0; 覆盖度=12.469; E 值=1.32e-08; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005576 | extracellular region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.0; 覆盖度=12.469; E 值=1.32e-08; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.0; 覆盖度=12.469; E 值=1.32e-08; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=38.889; 覆盖度=13.466; E 值=6.79e-08; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016020 | membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=38.889; 覆盖度=13.466; E 值=6.79e-08; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004842 | ubiquitin-protein transferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.0; 覆盖度=12.469; E 值=1.32e-08; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008270 | zinc ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.0; 覆盖度=12.469; E 值=1.32e-08; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0061630 | ubiquitin protein ligase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.0; 覆盖度=12.469; E 值=1.32e-08; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G04240 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=38.889; 覆盖度=13.466; E 值=6.79e-08 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G35420 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=31.967; 覆盖度=30.424; E 值=2e-07 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G05200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.0; 覆盖度=12.469; E 值=1.32e-08 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0188200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=51.923; 覆盖度=12.968; E 值=1.13e-07 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |