基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_030763 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr06:122332309-122341501 (+) |
| 描述 | Similar to MRF1: MA3 DOMAIN-CONTAINING TRANSLATION REGULATORY FACTOR 1 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_030763 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 13 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g63190 |
参与雷帕霉素 靶标调节的翻译控制,尤其是在能量不足的条件下。 | |
At4g24800 |
参与雷帕霉素靶标 调节的翻译控制,尤其是在能量不足的条件下。 | |
At3g48390 |
参与雷帕霉素靶点(TOR)调控的翻译控制,尤其在能量缺乏条件下。 | |
At3g48380 |
含硫蛋白酶,可识别并水解 UFM1(一种与多个靶蛋白结合的泛素样修饰蛋白)C 端的甘氨酸肽键。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os12g0285500 |
硫醇蛋白酶,可识别并水解富铁蛋白1(ufm-1,一种与多种靶蛋白结合的泛素样修饰蛋白)C端甘氨酸的肽键。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006417 | regulation of translation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=72.7; 覆盖度=43.936; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009646 | response to absence of light | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=72.7; 覆盖度=43.936; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009651 | response to salt stress | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=70.972; 覆盖度=45.659; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009723 | response to ethylene | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=70.972; 覆盖度=45.659; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009873 | ethylene-activated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=70.972; 覆盖度=45.659; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045892 | negative regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=72.7; 覆盖度=43.936; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0090549 | response to carbon starvation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=72.7; 覆盖度=43.936; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=72.7; 覆盖度=43.936; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=70.972; 覆盖度=45.659; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005794 | Golgi apparatus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=70.972; 覆盖度=45.659; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=72.7; 覆盖度=43.936; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003729 | mRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=72.7; 覆盖度=43.936; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0043022 | ribosome binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=72.7; 覆盖度=43.936; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G48390 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=70.618; 覆盖度=39.695; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G24800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=70.972; 覆盖度=45.659; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G63190 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=72.7; 覆盖度=43.936; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |