基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_029353 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr06:88235624-88238656 (+) |
| 描述 | Similar to IRL5: Plant intracellular Ras-group-related LRR protein 5 (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_029353 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 6 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g35470 |
富含亮氨酸的重复蛋白,可能在信号转导的背景下介导蛋白质相互作用。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g17440 |
富含亮氨酸的重复蛋白,可能在信号转导的背景下介导蛋白质相互作用。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g05850 |
富含亮氨酸的重复蛋白,可能在信号转导的背景下介导蛋白质相互作用。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os10g0572300 |
富含亮氨酸的重复蛋白,可能在信号转导的背景下介导蛋白质相互作用。 | 暂无已核实直接文献 |
Os08g0511700 |
富含亮氨酸的重复蛋白,可能在信号转导的背景下介导蛋白质相互作用。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009416 | response to light stimulus | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.188; 覆盖度=69.452; E 值=6.42e-162; UniProt GO evidence=IEP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009555 | pollen development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=44.398; 覆盖度=31.462; E 值=3.74e-53; UniProt GO evidence=IGI:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0035556 | intracellular signal transduction | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.188; 覆盖度=69.452; E 值=6.42e-162; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0055046 | microgametogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=44.398; 覆盖度=31.462; E 值=3.74e-53; UniProt GO evidence=IGI:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=46.429; 覆盖度=69.452; E 值=5.34e-144; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=46.429; 覆盖度=69.452; E 值=5.34e-144; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G17440 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=45.161; 覆盖度=68.799; E 值=3.94e-135 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G35470 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=46.429; 覆盖度=69.452; E 值=5.34e-144 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G05850 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=44.398; 覆盖度=31.462; E 值=3.74e-53 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os08g0511700 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=41.741; 覆盖度=73.499; E 值=4.71e-130 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os10g0572300 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.188; 覆盖度=69.452; E 值=6.42e-162 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |