本页使用教程

基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

下载当前结果

基因 IDLXL04_021152
当前查询版本OH1004
位置Chr04:122803168-122805459 (+)
描述Similar to At1g26460: Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g26460%2C mitochondrial (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_021152 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 13 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g26460 含五肽重复的蛋白 At1g26460,线粒体。 暂无已核实直接文献
At1g09900 含五重复肽结构蛋白 At1g09900。 暂无已核实直接文献
At3g46610 通过与光依赖的机制结合 PSII 亚基 mRNA(如 psbJ、psbN 和 psbA)的 5' 非翻译区,参与光调控的光系统 II (PSII) 生物发生和基粒类囊体形成,并促进 HCF173 与目标 mRNA 的结合,这些 mRNA 编码 PSII 反应中心蛋白(如 J、N 和 D1),从而通过调节核糖体加载调控其表达。
At5g41170 含五聚肽重复的线粒体蛋白 At5g41170。 暂无已核实直接文献
At3g06920 含五重复肽序列的蛋白 At3g06920。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0006413translational initiation生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=21.903; 覆盖度=73.021; E 值=6.84e-13; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009416response to light stimulus生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=21.903; 覆盖度=73.021; E 值=6.84e-13; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009555pollen development生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=22.654; 覆盖度=70.598; E 值=9.85e-13; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0010207photosystem II assembly生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=21.903; 覆盖度=73.021; E 值=6.84e-13; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0032544plastid translation生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=21.903; 覆盖度=73.021; E 值=6.84e-13; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005739mitochondrion细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.995; 覆盖度=100.646; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009507chloroplast细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=20.65; 覆盖度=69.628; E 值=5.5e-13; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009535chloroplast thylakoid membrane细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=21.903; 覆盖度=73.021; E 值=6.84e-13; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009570chloroplast stroma细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=21.903; 覆盖度=73.021; E 值=6.84e-13; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003723RNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=21.903; 覆盖度=73.021; E 值=6.84e-13; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003729mRNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.995; 覆盖度=100.646; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0008494translation activator activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=21.903; 覆盖度=73.021; E 值=6.84e-13; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0043022ribosome binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=21.903; 覆盖度=73.021; E 值=6.84e-13; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G09900KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=20.65; 覆盖度=69.628; E 值=5.5e-13UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G26460KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.995; 覆盖度=100.646; E 值=0.0UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G06920KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=21.478; 覆盖度=69.952; E 值=3.13e-12UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G46610KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=21.903; 覆盖度=73.021; E 值=6.84e-13UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G41170KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=22.654; 覆盖度=70.598; E 值=9.85e-13UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release